德州学院学报
德州學院學報
덕주학원학보
JOURNAL OF DEZHOU UNIVERSITY
2014年
2期
19-22,108
,共5页
嗜盐古菌%密码子偏好分析%基因组
嗜鹽古菌%密碼子偏好分析%基因組
기염고균%밀마자편호분석%기인조
进化是生物最本质的特征,一直以来,密码子偏好分析是基因组进化研究领域的热点命题之一.文中以极端嗜盐古菌Haloarcula hispanica基因组为研究对象,基于不同密码子偏好描述参数对该基因组大、小染色体及质粒的蛋白质编码基因中密码子使用特点进行了系统研究.结果表明Haloarcula hispanica基因组各组分蛋白质编码基因倾向使用以G/C结尾的密码子,在偏好的26个密码子中只有两个密码子的使用在大、小染色体和质粒之间存在差异.进一步基于多种描述参数的对应分析发现大、小染色体中各参数的相关系数存在相似性,而与质粒则出现了较大的差异,这可能与三者之间的进化关系有关,因而该工作为今后原核生物大小染色体与质粒之间进化关系的研究提供了可靠依据.
進化是生物最本質的特徵,一直以來,密碼子偏好分析是基因組進化研究領域的熱點命題之一.文中以極耑嗜鹽古菌Haloarcula hispanica基因組為研究對象,基于不同密碼子偏好描述參數對該基因組大、小染色體及質粒的蛋白質編碼基因中密碼子使用特點進行瞭繫統研究.結果錶明Haloarcula hispanica基因組各組分蛋白質編碼基因傾嚮使用以G/C結尾的密碼子,在偏好的26箇密碼子中隻有兩箇密碼子的使用在大、小染色體和質粒之間存在差異.進一步基于多種描述參數的對應分析髮現大、小染色體中各參數的相關繫數存在相似性,而與質粒則齣現瞭較大的差異,這可能與三者之間的進化關繫有關,因而該工作為今後原覈生物大小染色體與質粒之間進化關繫的研究提供瞭可靠依據.
진화시생물최본질적특정,일직이래,밀마자편호분석시기인조진화연구영역적열점명제지일.문중이겁단기염고균Haloarcula hispanica기인조위연구대상,기우불동밀마자편호묘술삼수대해기인조대、소염색체급질립적단백질편마기인중밀마자사용특점진행료계통연구.결과표명Haloarcula hispanica기인조각조분단백질편마기인경향사용이G/C결미적밀마자,재편호적26개밀마자중지유량개밀마자적사용재대、소염색체화질립지간존재차이.진일보기우다충묘술삼수적대응분석발현대、소염색체중각삼수적상관계수존재상사성,이여질립칙출현료교대적차이,저가능여삼자지간적진화관계유관,인이해공작위금후원핵생물대소염색체여질립지간진화관계적연구제공료가고의거.
