中国人兽共患病学报
中國人獸共患病學報
중국인수공환병학보
CHINESE JOURNAL OF ZOONOSES
2014年
6期
583-587
,共5页
陈川%荆春霞%张鲍欢%张丽菊%黄伟煌%井立鹏%东方%杨光
陳川%荊春霞%張鮑歡%張麗菊%黃偉煌%井立鵬%東方%楊光
진천%형춘하%장포환%장려국%황위황%정립붕%동방%양광
微小隐孢子虫%WD40结构域%生物信息学分析%功能预测
微小隱孢子蟲%WD40結構域%生物信息學分析%功能預測
미소은포자충%WD40결구역%생물신식학분석%공능예측
Cryptosporidium parvum%WD40 domains%bioinformatics analysis%functional prediction Alpha
目的 对微小隐孢子虫中含WD40结构域的蛋白进行生物信息学分析,分析该蛋白家族的WD40结构并预测其功能,为微小隐孢子虫基因功能的研究提供一定的基础理论.方法 通过隐孢子虫基因组数据库收集数据,获得微小隐孢子虫含WD40结构域蛋白家族的序列信息,搜索每个蛋白的CDD结构域并进行NCBI BLAST比对分析,确定为WD40结构域家族蛋白,分析结构域并预测功能.结果 在C.parvum Iowa Ⅱ中共搜索到50个含有WD40结构域的蛋白,其中cgd1_1930、cgd5_740和cgd4_3360含有CAF1C_H4-bd超家族结构,可能参与DNA修复和DNA复制过程;cgd4_260含有ACE1-Sec16-like超家族,可能参与囊泡的形成和物质运输;cgd1_2600含有TAF5 NTD2结构域,可能参与蛋白与蛋白的相互作用.结论 在微小隐孢子虫中,WD40蛋白家族不仅可能单独发挥作用,而且还能通过相互辅助、结合发挥其生物效应.
目的 對微小隱孢子蟲中含WD40結構域的蛋白進行生物信息學分析,分析該蛋白傢族的WD40結構併預測其功能,為微小隱孢子蟲基因功能的研究提供一定的基礎理論.方法 通過隱孢子蟲基因組數據庫收集數據,穫得微小隱孢子蟲含WD40結構域蛋白傢族的序列信息,搜索每箇蛋白的CDD結構域併進行NCBI BLAST比對分析,確定為WD40結構域傢族蛋白,分析結構域併預測功能.結果 在C.parvum Iowa Ⅱ中共搜索到50箇含有WD40結構域的蛋白,其中cgd1_1930、cgd5_740和cgd4_3360含有CAF1C_H4-bd超傢族結構,可能參與DNA脩複和DNA複製過程;cgd4_260含有ACE1-Sec16-like超傢族,可能參與囊泡的形成和物質運輸;cgd1_2600含有TAF5 NTD2結構域,可能參與蛋白與蛋白的相互作用.結論 在微小隱孢子蟲中,WD40蛋白傢族不僅可能單獨髮揮作用,而且還能通過相互輔助、結閤髮揮其生物效應.
목적 대미소은포자충중함WD40결구역적단백진행생물신식학분석,분석해단백가족적WD40결구병예측기공능,위미소은포자충기인공능적연구제공일정적기출이론.방법 통과은포자충기인조수거고수집수거,획득미소은포자충함WD40결구역단백가족적서렬신식,수색매개단백적CDD결구역병진행NCBI BLAST비대분석,학정위WD40결구역가족단백,분석결구역병예측공능.결과 재C.parvum Iowa Ⅱ중공수색도50개함유WD40결구역적단백,기중cgd1_1930、cgd5_740화cgd4_3360함유CAF1C_H4-bd초가족결구,가능삼여DNA수복화DNA복제과정;cgd4_260함유ACE1-Sec16-like초가족,가능삼여낭포적형성화물질운수;cgd1_2600함유TAF5 NTD2결구역,가능삼여단백여단백적상호작용.결론 재미소은포자충중,WD40단백가족불부가능단독발휘작용,이차환능통과상호보조、결합발휘기생물효응.
