中南大学学报(医学版)
中南大學學報(醫學版)
중남대학학보(의학판)
JOURNAL OF CENTRAL SOUTH UNIVERSITY (MEDICAL SCIENCES)
2014年
6期
541-551
,共11页
蛋白质分类%多重对接%聚类分析%磷脂代谢网络
蛋白質分類%多重對接%聚類分析%燐脂代謝網絡
단백질분류%다중대접%취류분석%린지대사망락
protein classification%multiple-docking%clustering analysis%phospholipid metabolizing pathway
目的:拟在分析蛋白的功能聚类和体内作用基础上,建立生物体内蛋白质的生理功能相关网络,相关研究结果有助于在基于整体生物学功能理解的基础上做出正确的选择.方法:通过多重对接策略构建生物功能网络,采用受体-配体相互作用强度分子指纹图谱揭示蛋白质未知的生物学功能以及它们之间的联系.结果:对包含27个蛋白酶和28个内源性生物活性分子的磷脂代谢网络进行了重构计算,从蛋白质-配基作用网络的重构和基于生物网络的分子设计两个方面研究了直接相互作用方法在实际生物体系中的有效性.结论:对于弱相互作用的生物体系,通过多次平行的对接计算和聚类分析方法可达到有效的排名和认定真正存在的相互作用的目的;本研究所建立的基于多重对接和受体-配体相互作用强度指纹图谱的生物网络重构计算策略可进一步作为一类有效的工具,广泛应用在蛋白质分类、靶标选择和抑制剂的设计中.
目的:擬在分析蛋白的功能聚類和體內作用基礎上,建立生物體內蛋白質的生理功能相關網絡,相關研究結果有助于在基于整體生物學功能理解的基礎上做齣正確的選擇.方法:通過多重對接策略構建生物功能網絡,採用受體-配體相互作用彊度分子指紋圖譜揭示蛋白質未知的生物學功能以及它們之間的聯繫.結果:對包含27箇蛋白酶和28箇內源性生物活性分子的燐脂代謝網絡進行瞭重構計算,從蛋白質-配基作用網絡的重構和基于生物網絡的分子設計兩箇方麵研究瞭直接相互作用方法在實際生物體繫中的有效性.結論:對于弱相互作用的生物體繫,通過多次平行的對接計算和聚類分析方法可達到有效的排名和認定真正存在的相互作用的目的;本研究所建立的基于多重對接和受體-配體相互作用彊度指紋圖譜的生物網絡重構計算策略可進一步作為一類有效的工具,廣汎應用在蛋白質分類、靶標選擇和抑製劑的設計中.
목적:의재분석단백적공능취류화체내작용기출상,건립생물체내단백질적생리공능상관망락,상관연구결과유조우재기우정체생물학공능리해적기출상주출정학적선택.방법:통과다중대접책략구건생물공능망락,채용수체-배체상호작용강도분자지문도보게시단백질미지적생물학공능이급타문지간적련계.결과:대포함27개단백매화28개내원성생물활성분자적린지대사망락진행료중구계산,종단백질-배기작용망락적중구화기우생물망락적분자설계량개방면연구료직접상호작용방법재실제생물체계중적유효성.결론:대우약상호작용적생물체계,통과다차평행적대접계산화취류분석방법가체도유효적배명화인정진정존재적상호작용적목적;본연구소건립적기우다중대접화수체-배체상호작용강도지문도보적생물망락중구계산책략가진일보작위일류유효적공구,엄범응용재단백질분류、파표선택화억제제적설계중.