烟草科技
煙草科技
연초과기
TOBACCO SCIENCE & TECHNOLOGY
2014年
9期
68-72
,共5页
蔡刘体%刘艳霞%李想%孟琳%石俊雄
蔡劉體%劉豔霞%李想%孟琳%石俊雄
채류체%류염하%리상%맹림%석준웅
烟草%青枯病%青枯菌%基因组%三型分泌系统%三型效应蛋白因子
煙草%青枯病%青枯菌%基因組%三型分泌繫統%三型效應蛋白因子
연초%청고병%청고균%기인조%삼형분비계통%삼형효응단백인자
Tobacco%Bacterial wilt disease%Ralstonia solanacearum%Genome%Type Ⅲ secretion system%Type Ⅲ effector protein
青枯菌三型分泌系统的效应蛋白因子是青枯菌致病的主要决定因子之一,三型分泌系统能将效应蛋白因子直接注入植物细胞内.为了解和掌握烟草青枯菌效应蛋白因子的信息,在烟草青枯菌FQY_4全基因组序列的基础上,通过效应蛋白因子数据库和软件分析了FQY_4株系的效应蛋白因子.结果显示,青枯菌FQY_4的染色体和巨大质粒上共编码74个效应蛋白因子,其中大多数效应蛋白因子只有一个拷贝,但是RipT,RipAM和RipTPS有多个拷贝,RipJ在染色体和巨大质粒上均能编码;青枯菌4个种系型(Phylotype Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ)中已完成基因组测序的11个株系具有32个核心效应蛋白因子.
青枯菌三型分泌繫統的效應蛋白因子是青枯菌緻病的主要決定因子之一,三型分泌繫統能將效應蛋白因子直接註入植物細胞內.為瞭解和掌握煙草青枯菌效應蛋白因子的信息,在煙草青枯菌FQY_4全基因組序列的基礎上,通過效應蛋白因子數據庫和軟件分析瞭FQY_4株繫的效應蛋白因子.結果顯示,青枯菌FQY_4的染色體和巨大質粒上共編碼74箇效應蛋白因子,其中大多數效應蛋白因子隻有一箇拷貝,但是RipT,RipAM和RipTPS有多箇拷貝,RipJ在染色體和巨大質粒上均能編碼;青枯菌4箇種繫型(Phylotype Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ)中已完成基因組測序的11箇株繫具有32箇覈心效應蛋白因子.
청고균삼형분비계통적효응단백인자시청고균치병적주요결정인자지일,삼형분비계통능장효응단백인자직접주입식물세포내.위료해화장악연초청고균효응단백인자적신식,재연초청고균FQY_4전기인조서렬적기출상,통과효응단백인자수거고화연건분석료FQY_4주계적효응단백인자.결과현시,청고균FQY_4적염색체화거대질립상공편마74개효응단백인자,기중대다수효응단백인자지유일개고패,단시RipT,RipAM화RipTPS유다개고패,RipJ재염색체화거대질립상균능편마;청고균4개충계형(Phylotype Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ)중이완성기인조측서적11개주계구유32개핵심효응단백인자.
