吉林广播电视大学学报
吉林廣播電視大學學報
길림엄파전시대학학보
JOURNAL OF JILIN TV & RADIO UNIVERSITY
2014年
4期
3-4
,共2页
SVM%CKSAAP%氨基酸频率计算%磷酸化位点预测
SVM%CKSAAP%氨基痠頻率計算%燐痠化位點預測
SVM%CKSAAP%안기산빈솔계산%린산화위점예측
本文利用LibSVM软件包对已通过改进过的CKSAAP方法特征提取出来的数值特征对磷酸化位点进行预测.结果表明,基于SVM和CKSAAP结合氨基酸频率方法的水稻蛋白质磷酸化位点预测在丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸的平均预测准确性为80.877％,马修斯系数为0.616.对比单纯使用CKSAAP准确性显著提高.与PlantPhos和Musite的预测性能的对比结果显示,在磷酸化酪氨酸位点的预测性能显著高于PlantPhos及Musite.
本文利用LibSVM軟件包對已通過改進過的CKSAAP方法特徵提取齣來的數值特徵對燐痠化位點進行預測.結果錶明,基于SVM和CKSAAP結閤氨基痠頻率方法的水稻蛋白質燐痠化位點預測在絲氨痠、囌氨痠和酪氨痠的平均預測準確性為80.877％,馬脩斯繫數為0.616.對比單純使用CKSAAP準確性顯著提高.與PlantPhos和Musite的預測性能的對比結果顯示,在燐痠化酪氨痠位點的預測性能顯著高于PlantPhos及Musite.
본문이용LibSVM연건포대이통과개진과적CKSAAP방법특정제취출래적수치특정대린산화위점진행예측.결과표명,기우SVM화CKSAAP결합안기산빈솔방법적수도단백질린산화위점예측재사안산、소안산화락안산적평균예측준학성위80.877％,마수사계수위0.616.대비단순사용CKSAAP준학성현저제고.여PlantPhos화Musite적예측성능적대비결과현시,재린산화락안산위점적예측성능현저고우PlantPhos급Musite.
