CAJ | 학술논문

为获得烟草AREB/ABF(ABA响应元件结合蛋白/ABRE结合因子)家族转录因子基因序列,进一步提高烟草的抗渗透胁迫能力,通过同源比对和RT-PCR技术,从烟草品种红花大金元中克隆到烟草AREB/ABF家族转录因子NtABF1(GenBank登录号为KF736849),NtABF2(GenBank登录号为KF736850)基因编码序列,并进一步利用生物信息学分析软件对这两个转录因子的蛋白理化性质、高级结构和生物学功能进行了预测.结果表明:NtABF1基因开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)长999 bp,编码332个氨基酸,蛋白分子量36.45 kDa,等电点9.04;NtABF2基因ORF长1305 bp,编码433个氨基酸,蛋白分子量46.92kDa,等电点9.35.NtABF1和NtABF2均为含有BRLZ(Basic Region and Leucine Zipper)保守结构域的亲水蛋白,不含信号肽与跨膜结构.其高级结构均以α螺旋和无规则卷曲为主,β转角和延伸链含量较少.在亚细胞水平上,NtABF1和NtABF2均定位于细胞核.磷酸化位点分析表明,两蛋白均含有丝氨酸,苏氨酸和酪氨酸等激酶识别位点.进化分析和多序列比对结果表明,NtABF1与AtAREB3的进化关系最近,序列相似性达54.49％;NtABF2与SlAREB1,StABF1和StABF的亲缘关系较近,序列相似性分别为83.63％,83.52％和83％.功能预测结果显示,NtABF1和NtABF2均为转录调控因子.
위획득연초AREB/ABF(ABA향응원건결합단백/ABRE결합인자)가족전록인자기인서렬,진일보제고연초적항삼투협박능력,통과동원비대화RT-PCR기술,종연초품충홍화대금원중극륭도연초AREB/ABF가족전록인자NtABF1(GenBank등록호위KF736849),NtABF2(GenBank등록호위KF736850)기인편마서렬,병진일보이용생물신식학분석연건대저량개전록인자적단백이화성질、고급결구화생물학공능진행료예측.결과표명:NtABF1기인개방열독광(Open Reading Frame,ORF)장999 bp,편마332개안기산,단백분자량36.45 kDa,등전점9.04;NtABF2기인ORF장1305 bp,편마433개안기산,단백분자량46.92kDa,등전점9.35.NtABF1화NtABF2균위함유BRLZ(Basic Region and Leucine Zipper)보수결구역적친수단백,불함신호태여과막결구.기고급결구균이α라선화무규칙권곡위주,β전각화연신련함량교소.재아세포수평상,NtABF1화NtABF2균정위우세포핵.린산화위점분석표명,량단백균함유사안산,소안산화락안산등격매식별위점.진화분석화다서렬비대결과표명,NtABF1여AtAREB3적진화관계최근,서렬상사성체54.49％;NtABF2여SlAREB1,StABF1화StABF적친연관계교근,서렬상사성분별위83.63％,83.52％화83％.공능예측결과현시,NtABF1화NtABF2균위전록조공인자.