林业科学研究
林業科學研究
임업과학연구
FOREST RESEARCH
2014年
3期
374-380
,共7页
肖政%李纪元%范正琪%殷恒福
肖政%李紀元%範正琪%慇恆福
초정%리기원%범정기%은항복
荔波连蕊茶%肌动蛋白基因%序列分析%克隆
荔波連蕊茶%肌動蛋白基因%序列分析%剋隆
려파련예다%기동단백기인%서렬분석%극륭
Camellia lipoensis%actin gene%sequence analysis%cloning
根据植物肌动蛋白(Actin)基因编码区的保守序列设计引物,以山茶属植物荔波连蕊茶幼嫩茎段为材料,提取总RNA,进行RT-PCR.采用RACE技术扩增获得1 631 bp的Actin基因全长cDNA序列,命名为ClActinl(GenBank登录号KF366912).序列分析表明,ClActinl 开放阅读框(ORF)为1 134 bp,编码377个氨基酸,5'非编码区90 bp,3'非编码区407 bp.预测的ClActinl蛋白分子量为41.69 kD,理论等电点为5.31,具有Actin超基因家族的保守结构域和肌动蛋白家族特有的特征信号序列.ClActinl与GenBank中收录的其它植物肌动蛋白核苷酸序列的相似性在82％以上,氨基酸序列的相似性在97％以上.与其它植物肌动蛋白比较并构建系统进化树,结果显示山茶肌动蛋白与茶树和杨树的肌动蛋白的亲缘关系最为密切.实时荧光定量PCR结果显示,该基因在荔波边蕊茶不同组织器官及不同发育时期的表达量稳定,表明ClActinl 基因可作为内参基因.
根據植物肌動蛋白(Actin)基因編碼區的保守序列設計引物,以山茶屬植物荔波連蕊茶幼嫩莖段為材料,提取總RNA,進行RT-PCR.採用RACE技術擴增穫得1 631 bp的Actin基因全長cDNA序列,命名為ClActinl(GenBank登錄號KF366912).序列分析錶明,ClActinl 開放閱讀框(ORF)為1 134 bp,編碼377箇氨基痠,5'非編碼區90 bp,3'非編碼區407 bp.預測的ClActinl蛋白分子量為41.69 kD,理論等電點為5.31,具有Actin超基因傢族的保守結構域和肌動蛋白傢族特有的特徵信號序列.ClActinl與GenBank中收錄的其它植物肌動蛋白覈苷痠序列的相似性在82％以上,氨基痠序列的相似性在97％以上.與其它植物肌動蛋白比較併構建繫統進化樹,結果顯示山茶肌動蛋白與茶樹和楊樹的肌動蛋白的親緣關繫最為密切.實時熒光定量PCR結果顯示,該基因在荔波邊蕊茶不同組織器官及不同髮育時期的錶達量穩定,錶明ClActinl 基因可作為內參基因.
근거식물기동단백(Actin)기인편마구적보수서렬설계인물,이산다속식물려파련예다유눈경단위재료,제취총RNA,진행RT-PCR.채용RACE기술확증획득1 631 bp적Actin기인전장cDNA서렬,명명위ClActinl(GenBank등록호KF366912).서렬분석표명,ClActinl 개방열독광(ORF)위1 134 bp,편마377개안기산,5'비편마구90 bp,3'비편마구407 bp.예측적ClActinl단백분자량위41.69 kD,이론등전점위5.31,구유Actin초기인가족적보수결구역화기동단백가족특유적특정신호서렬.ClActinl여GenBank중수록적기타식물기동단백핵감산서렬적상사성재82％이상,안기산서렬적상사성재97％이상.여기타식물기동단백비교병구건계통진화수,결과현시산다기동단백여다수화양수적기동단백적친연관계최위밀절.실시형광정량PCR결과현시,해기인재려파변예다불동조직기관급불동발육시기적표체량은정,표명ClActinl 기인가작위내삼기인.
