林业科学研究
林業科學研究
임업과학연구
FOREST RESEARCH
2014年
3期
349-355
,共7页
张伟溪%褚延广%黄秦军%张冰玉%丁昌俊%苏晓华
張偉溪%褚延廣%黃秦軍%張冰玉%丁昌俊%囌曉華
장위계%저연엄%황진군%장빙옥%정창준%소효화
欧洲黑杨%伸展蛋白基因%单核苷酸多态性%稳定碳同位素比率%关联分析
歐洲黑楊%伸展蛋白基因%單覈苷痠多態性%穩定碳同位素比率%關聯分析
구주흑양%신전단백기인%단핵감산다태성%은정탄동위소비솔%관련분석
Populus nigra%expansin%single nucleotide polymorphism%stable carbon isotope ratio%association analysis
对欧洲黑杨α-expansin基因PnEXPA1的SNP多态性与水分利用效率相关性状稳定碳同位素比率(δ13C)进行了关联分析.利用SNaPshot技术对PnEXPA1基因内11个SNP位点进行了基因型分型,发现各SNP位点优势基因型均为纯合,且其频率高于杂合基因型.关联分析显示:SNP8和SNP12在采用单因素方差分析(ANOVA)和一般线性模型(GLM)2种方法时均与δ13C值显著关联.SNP8为exon 1内的无义突变,可解释6.620％的表型变异;而SNP12位于intron 1中,遗传贡献率为6.613％;这2个SNP位点与SNP9、SNP13共同位于一个高连锁不平衡(LD)的单倍型块中.SNP8与SNP12的TT基因型无性系均具有较高的δ13C值,为优势基因型.
對歐洲黑楊α-expansin基因PnEXPA1的SNP多態性與水分利用效率相關性狀穩定碳同位素比率(δ13C)進行瞭關聯分析.利用SNaPshot技術對PnEXPA1基因內11箇SNP位點進行瞭基因型分型,髮現各SNP位點優勢基因型均為純閤,且其頻率高于雜閤基因型.關聯分析顯示:SNP8和SNP12在採用單因素方差分析(ANOVA)和一般線性模型(GLM)2種方法時均與δ13C值顯著關聯.SNP8為exon 1內的無義突變,可解釋6.620％的錶型變異;而SNP12位于intron 1中,遺傳貢獻率為6.613％;這2箇SNP位點與SNP9、SNP13共同位于一箇高連鎖不平衡(LD)的單倍型塊中.SNP8與SNP12的TT基因型無性繫均具有較高的δ13C值,為優勢基因型.
대구주흑양α-expansin기인PnEXPA1적SNP다태성여수분이용효솔상관성상은정탄동위소비솔(δ13C)진행료관련분석.이용SNaPshot기술대PnEXPA1기인내11개SNP위점진행료기인형분형,발현각SNP위점우세기인형균위순합,차기빈솔고우잡합기인형.관련분석현시:SNP8화SNP12재채용단인소방차분석(ANOVA)화일반선성모형(GLM)2충방법시균여δ13C치현저관련.SNP8위exon 1내적무의돌변,가해석6.620％적표형변이;이SNP12위우intron 1중,유전공헌솔위6.613％;저2개SNP위점여SNP9、SNP13공동위우일개고련쇄불평형(LD)적단배형괴중.SNP8여SNP12적TT기인형무성계균구유교고적δ13C치,위우세기인형.
