癌症进展
癌癥進展
암증진전
ONCOLOGY PROGRESS
2014年
3期
216-220
,共5页
杨芳%陈凤霞%张文文%管晓翔
楊芳%陳鳳霞%張文文%管曉翔
양방%진봉하%장문문%관효상
TXNIP%生物信息学分析%基因多态性%启动子区%甲基化%转录因子结合部位
TXNIP%生物信息學分析%基因多態性%啟動子區%甲基化%轉錄因子結閤部位
TXNIP%생물신식학분석%기인다태성%계동자구%갑기화%전록인자결합부위
TXNIP%bioinformatics analysis%genetic polymorphism%promoter%methylation%binding sites of tran-scription factors
目的:探究TXNIP的基因多态性和启动子区甲基化CpG岛、转录因子结合位点。方法利用生物信息学在线软件获得TXNIP基因3′UTR多态性和mRNA的表达情况;利用相关软件获得TXNIP启动子区序列,预测甲基化CpG岛及转录因子结合部位。结果 TXNIP基因3′UTR多态性位点rs7211、 rs7212和rs4755的不同基因型与mRNA表达差异有统计学意义( P<0.05);启动子区序列中甲基化CpG岛位于1763~1943 bp处。结论利用生物信息学分析可以更有效地了解基因多态性和启动子区在基因表达调控中的作用。
目的:探究TXNIP的基因多態性和啟動子區甲基化CpG島、轉錄因子結閤位點。方法利用生物信息學在線軟件穫得TXNIP基因3′UTR多態性和mRNA的錶達情況;利用相關軟件穫得TXNIP啟動子區序列,預測甲基化CpG島及轉錄因子結閤部位。結果 TXNIP基因3′UTR多態性位點rs7211、 rs7212和rs4755的不同基因型與mRNA錶達差異有統計學意義( P<0.05);啟動子區序列中甲基化CpG島位于1763~1943 bp處。結論利用生物信息學分析可以更有效地瞭解基因多態性和啟動子區在基因錶達調控中的作用。
목적:탐구TXNIP적기인다태성화계동자구갑기화CpG도、전록인자결합위점。방법이용생물신식학재선연건획득TXNIP기인3′UTR다태성화mRNA적표체정황;이용상관연건획득TXNIP계동자구서렬,예측갑기화CpG도급전록인자결합부위。결과 TXNIP기인3′UTR다태성위점rs7211、 rs7212화rs4755적불동기인형여mRNA표체차이유통계학의의( P<0.05);계동자구서렬중갑기화CpG도위우1763~1943 bp처。결론이용생물신식학분석가이경유효지료해기인다태성화계동자구재기인표체조공중적작용。
Objective To explore the TXNIP polymorphism in 3′UTR, the methylated CpG island and binding sites of transcription factor in its promoter region. Method The SNPs in TXNIP 3′UTR and their mRNA expressions were ob-tained via online bioinformatics software;And TXNIP promoter sequences were analyzed to predict methylated CpG island and the binding sites of transcription factors. Result The genotypes of SNPs in TXNIP 3′UTR, rs7211, rs7212 and rs4755, are significantly associated with the mRNA expression ( P<0. 05);And the methylated CpG island in promoter re-gion located on 1763-1943 bp. Conclusion With bioinformatics analysis, we can better understand the role of genetic polymorphism and the promoter region in the regulation of gene expression.