计算机与应用化学
計算機與應用化學
계산궤여응용화학
COMPUTERS AND APPLIED CHEMISTRY
2014年
6期
727-731
,共5页
张丽杰%李雪楠%李昊阳%周家蓬%陈禹保
張麗傑%李雪楠%李昊暘%週傢蓬%陳禹保
장려걸%리설남%리호양%주가봉%진우보
ACOT1%ACOT1_MULT%序列突变%氢键%疏水相互作用%分子动力学模拟
ACOT1%ACOT1_MULT%序列突變%氫鍵%疏水相互作用%分子動力學模擬
ACOT1%ACOT1_MULT%서렬돌변%경건%소수상호작용%분자동역학모의
ACOT1%ACOT1_MULT%point mutation%hydrogen bond%hydrophobic effect%molecule dynamics
酰基辅酶硫醣酶(Acyl-CoA thioesterases,ACOTs),也被称作酰基辅酶A水解酶,是一类能够水解酰基辅酶A酯类水解的酶,在脂肪酸的代谢中起着重要的作用.文中通过将序列分析得到的ACOT1的有害突变序列(ACOTl _MULT)和野生型序列利用同源建模的方法得到了相应的蛋白结构,并利用分子动力学模拟的方法研究了突变氨基酸对蛋白结构造成的影响.研究结果发现:突变蛋白在分子动力学过程中活性中心上面的“盖子”(LEU374-SER380)区域打开,而野生型一直处于关闭状态.通过对氢键和疏水作用的分析发现,突变位置的氨基酸(ALA189THR)与蛋白序列中的GLY169形成了新的氢键,突变残基附近的氢键也发生了很大的变化,导致了α/β水解酶区域的第3个β折叠的末端Loop区(160Loop)朝着外侧的亲水性区域拉伸.160Loop区域的变化使得它与“盖子”区域之间的疏水相互作用消失,“盖子”区域的稳定性下降,并最终导致了“盖子”的打开.该结果对ACOT1蛋白相关的人类免疫病毒缺陷疾病和附睾炎等疾病的发病机理的研究具有很好的借鉴作用,同时也为基于该活性区域的抑制剂筛选工作提供了新的靶点.
酰基輔酶硫醣酶(Acyl-CoA thioesterases,ACOTs),也被稱作酰基輔酶A水解酶,是一類能夠水解酰基輔酶A酯類水解的酶,在脂肪痠的代謝中起著重要的作用.文中通過將序列分析得到的ACOT1的有害突變序列(ACOTl _MULT)和野生型序列利用同源建模的方法得到瞭相應的蛋白結構,併利用分子動力學模擬的方法研究瞭突變氨基痠對蛋白結構造成的影響.研究結果髮現:突變蛋白在分子動力學過程中活性中心上麵的“蓋子”(LEU374-SER380)區域打開,而野生型一直處于關閉狀態.通過對氫鍵和疏水作用的分析髮現,突變位置的氨基痠(ALA189THR)與蛋白序列中的GLY169形成瞭新的氫鍵,突變殘基附近的氫鍵也髮生瞭很大的變化,導緻瞭α/β水解酶區域的第3箇β摺疊的末耑Loop區(160Loop)朝著外側的親水性區域拉伸.160Loop區域的變化使得它與“蓋子”區域之間的疏水相互作用消失,“蓋子”區域的穩定性下降,併最終導緻瞭“蓋子”的打開.該結果對ACOT1蛋白相關的人類免疫病毒缺陷疾病和附睪炎等疾病的髮病機理的研究具有很好的藉鑒作用,同時也為基于該活性區域的抑製劑篩選工作提供瞭新的靶點.
선기보매류당매(Acyl-CoA thioesterases,ACOTs),야피칭작선기보매A수해매,시일류능구수해선기보매A지류수해적매,재지방산적대사중기착중요적작용.문중통과장서렬분석득도적ACOT1적유해돌변서렬(ACOTl _MULT)화야생형서렬이용동원건모적방법득도료상응적단백결구,병이용분자동역학모의적방법연구료돌변안기산대단백결구조성적영향.연구결과발현:돌변단백재분자동역학과정중활성중심상면적“개자”(LEU374-SER380)구역타개,이야생형일직처우관폐상태.통과대경건화소수작용적분석발현,돌변위치적안기산(ALA189THR)여단백서렬중적GLY169형성료신적경건,돌변잔기부근적경건야발생료흔대적변화,도치료α/β수해매구역적제3개β절첩적말단Loop구(160Loop)조착외측적친수성구역랍신.160Loop구역적변화사득타여“개자”구역지간적소수상호작용소실,“개자”구역적은정성하강,병최종도치료“개자”적타개.해결과대ACOT1단백상관적인류면역병독결함질병화부고염등질병적발병궤리적연구구유흔호적차감작용,동시야위기우해활성구역적억제제사선공작제공료신적파점.
