作物学报
作物學報
작물학보
ACTA AGRONOMICA SINICA
2014年
7期
1213-1219
,共7页
张立武%袁民航%何雄威%刘星%方平平%林荔辉%陶爱芬%徐建堂%祁建民
張立武%袁民航%何雄威%劉星%方平平%林荔輝%陶愛芬%徐建堂%祁建民
장립무%원민항%하웅위%류성%방평평%림려휘%도애분%서건당%기건민
黄麻%EST%SSR%标记开发%多态性
黃痳%EST%SSR%標記開髮%多態性
황마%EST%SSR%표기개발%다태성
Jute%EST%SSR%Marker development%Polymorphism
从GenBank公共数据库中下载黄麻表达序列标签838条,利用SSRPrimer软件对其进行SSR位点查找,利用Primer 3.0软件设计66对SSR引物,通过琼脂糖凝胶研究这些SSR引物的PCR扩增特点,以检测其多态性.结果表明,66对SSR引物在黄麻属6个不同类型材料的扩增中,42 (63.6％)对引物至少在2个材料之间存在多态性.(AT)n重复基元和(GC-)n丰富的三核苷酸重复基元多态性较高,可作为黄麻SSR标记引物设计的首选.黄麻EST-SSR标记开发效率较高,不仅可以丰富黄麻分子标记的数量,而且为剖析黄麻重要性状的遗传机制奠定基础,这对于黄麻的遗传基础研究具有重要应用价值.
從GenBank公共數據庫中下載黃痳錶達序列標籤838條,利用SSRPrimer軟件對其進行SSR位點查找,利用Primer 3.0軟件設計66對SSR引物,通過瓊脂糖凝膠研究這些SSR引物的PCR擴增特點,以檢測其多態性.結果錶明,66對SSR引物在黃痳屬6箇不同類型材料的擴增中,42 (63.6％)對引物至少在2箇材料之間存在多態性.(AT)n重複基元和(GC-)n豐富的三覈苷痠重複基元多態性較高,可作為黃痳SSR標記引物設計的首選.黃痳EST-SSR標記開髮效率較高,不僅可以豐富黃痳分子標記的數量,而且為剖析黃痳重要性狀的遺傳機製奠定基礎,這對于黃痳的遺傳基礎研究具有重要應用價值.
종GenBank공공수거고중하재황마표체서렬표첨838조,이용SSRPrimer연건대기진행SSR위점사조,이용Primer 3.0연건설계66대SSR인물,통과경지당응효연구저사SSR인물적PCR확증특점,이검측기다태성.결과표명,66대SSR인물재황마속6개불동류형재료적확증중,42 (63.6％)대인물지소재2개재료지간존재다태성.(AT)n중복기원화(GC-)n봉부적삼핵감산중복기원다태성교고,가작위황마SSR표기인물설계적수선.황마EST-SSR표기개발효솔교고,불부가이봉부황마분자표기적수량,이차위부석황마중요성상적유전궤제전정기출,저대우황마적유전기출연구구유중요응용개치.
