家畜生态学报
傢畜生態學報
가축생태학보
ACTA ECOLOGAE ANIMALIS DOMASTICI
2014年
5期
13-17,46
,共6页
王凤巧%党瑞华%黄洁萍%雷初朝%蓝贤勇%陈宏
王鳳巧%黨瑞華%黃潔萍%雷初朝%藍賢勇%陳宏
왕봉교%당서화%황길평%뢰초조%람현용%진굉
荷斯坦牛%Mx1基因%SNP%外显子%PCR-RFLP
荷斯坦牛%Mx1基因%SNP%外顯子%PCR-RFLP
하사탄우%Mx1기인%SNP%외현자%PCR-RFLP
Holstein cows%Mx1 gene%SNP%exon%PCR RFLP
牛Mx1基因位于1号染色体上,含有14个外显子,编码648个氨基酸.研究以346头陕西地区荷斯坦牛为研究对象,根据GenBank所提供的牛Mx1基因序列,设计15对引物,采用混合DNA池扩增测序和PCR-RFLP的方法对牛Mx1基因的14个外显子进行多态性分析.结果表明,4个SNPs,分别位于外显子3(g.843330 T>C,g.843411 A>G)、外显子4(g.844048 C>T)和外显子7(g.851325 T>C).其中,外显子4(g.844048 C>T)为同义突变;外显子3(g.843330 T>C,g.843411 A>G)两个位点的突变分别导致了异亮氨酸(Ile)向苏氨酸(Thr)、谷氨酸(Glu)向精氨酸(Arg)的突变;外显子7(g.851325 T>C)位点的突变导致亮氨酸(Leu)变为脯氨酸(Pro).4个SNPs位点都存在三种基因型,但纯合子的突变频率较低.4个SNPs位点共构建了11种单倍型,其中以H6为最主要的单倍型.结果显示,陕西地区荷斯坦牛Mx1基因存在较丰富的多态性,这将为Mx1基因结构和功能的研究以及将来在育种实践中的应用提供基础资料.
牛Mx1基因位于1號染色體上,含有14箇外顯子,編碼648箇氨基痠.研究以346頭陝西地區荷斯坦牛為研究對象,根據GenBank所提供的牛Mx1基因序列,設計15對引物,採用混閤DNA池擴增測序和PCR-RFLP的方法對牛Mx1基因的14箇外顯子進行多態性分析.結果錶明,4箇SNPs,分彆位于外顯子3(g.843330 T>C,g.843411 A>G)、外顯子4(g.844048 C>T)和外顯子7(g.851325 T>C).其中,外顯子4(g.844048 C>T)為同義突變;外顯子3(g.843330 T>C,g.843411 A>G)兩箇位點的突變分彆導緻瞭異亮氨痠(Ile)嚮囌氨痠(Thr)、穀氨痠(Glu)嚮精氨痠(Arg)的突變;外顯子7(g.851325 T>C)位點的突變導緻亮氨痠(Leu)變為脯氨痠(Pro).4箇SNPs位點都存在三種基因型,但純閤子的突變頻率較低.4箇SNPs位點共構建瞭11種單倍型,其中以H6為最主要的單倍型.結果顯示,陝西地區荷斯坦牛Mx1基因存在較豐富的多態性,這將為Mx1基因結構和功能的研究以及將來在育種實踐中的應用提供基礎資料.
우Mx1기인위우1호염색체상,함유14개외현자,편마648개안기산.연구이346두협서지구하사탄우위연구대상,근거GenBank소제공적우Mx1기인서렬,설계15대인물,채용혼합DNA지확증측서화PCR-RFLP적방법대우Mx1기인적14개외현자진행다태성분석.결과표명,4개SNPs,분별위우외현자3(g.843330 T>C,g.843411 A>G)、외현자4(g.844048 C>T)화외현자7(g.851325 T>C).기중,외현자4(g.844048 C>T)위동의돌변;외현자3(g.843330 T>C,g.843411 A>G)량개위점적돌변분별도치료이량안산(Ile)향소안산(Thr)、곡안산(Glu)향정안산(Arg)적돌변;외현자7(g.851325 T>C)위점적돌변도치량안산(Leu)변위포안산(Pro).4개SNPs위점도존재삼충기인형,단순합자적돌변빈솔교저.4개SNPs위점공구건료11충단배형,기중이H6위최주요적단배형.결과현시,협서지구하사탄우Mx1기인존재교봉부적다태성,저장위Mx1기인결구화공능적연구이급장래재육충실천중적응용제공기출자료.