西南农业学报
西南農業學報
서남농업학보
SOUTHWEST CHINA JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
3期
960-965
,共6页
陈璇%曾千春%张家瑞%胡尊红%李文正
陳璇%曾韆春%張傢瑞%鬍尊紅%李文正
진선%증천춘%장가서%호존홍%리문정
烟草%富含甘氨酸RNA结合蛋白%RGP-3%克隆%基因多样性
煙草%富含甘氨痠RNA結閤蛋白%RGP-3%剋隆%基因多樣性
연초%부함감안산RNA결합단백%RGP-3%극륭%기인다양성
Tobacco%Glycine-rich RNA-binding protein%RGP-3%Clone%Gene diversity
前期研究表明普通烟草(N.tabacum cv.Xanthi)中富含甘氨酸RNA结合蛋白基因(NtRGP-3),该基因为涉及渗透胁迫相关的一个重要转录后调节基因,本研究旨在明确烟草属不同种中RGP-3基因多样性.通过PCR同源克隆方法克隆了12个烟草种中RGP-3基因,对RGP-3基因及其编码蛋白的结构、变异和系统进化等方面进行了分析.结果显示,RGP-3在烟草属不同种中相似性介于89%~100%,其中栽培烟草种(N.tabacum _K326)和野生林烟草(N.sylvestris)相似性为100%;多序列比较显示,RGP-3在不同烟草种中存在484个变异位点,其中外显子中变异占8.88%,内含子中变异占79.55%.3'UTR中变异占11.57%,推导的氨基酸仅有14个变异位点,且RNA识别结构域(RRM)高度保守;系统进化分析显示,普通烟亚属(Tabacum)和碧冬烟亚属(Petunioides)中RGP-3遗传距离较近,而和黄花烟亚属(Rustica)较远,与植物分类学上烟草亲缘关系结论一致.研究结果表明烟草属中RGP-3基因变异丰富,而编码的蛋白较保守,且RGP-3基因能够较好地用于烟草系统进化分析,这些结果为进一步研究烟草属中RGP-3的生理功能奠定了基础.
前期研究錶明普通煙草(N.tabacum cv.Xanthi)中富含甘氨痠RNA結閤蛋白基因(NtRGP-3),該基因為涉及滲透脅迫相關的一箇重要轉錄後調節基因,本研究旨在明確煙草屬不同種中RGP-3基因多樣性.通過PCR同源剋隆方法剋隆瞭12箇煙草種中RGP-3基因,對RGP-3基因及其編碼蛋白的結構、變異和繫統進化等方麵進行瞭分析.結果顯示,RGP-3在煙草屬不同種中相似性介于89%~100%,其中栽培煙草種(N.tabacum _K326)和野生林煙草(N.sylvestris)相似性為100%;多序列比較顯示,RGP-3在不同煙草種中存在484箇變異位點,其中外顯子中變異佔8.88%,內含子中變異佔79.55%.3'UTR中變異佔11.57%,推導的氨基痠僅有14箇變異位點,且RNA識彆結構域(RRM)高度保守;繫統進化分析顯示,普通煙亞屬(Tabacum)和碧鼕煙亞屬(Petunioides)中RGP-3遺傳距離較近,而和黃花煙亞屬(Rustica)較遠,與植物分類學上煙草親緣關繫結論一緻.研究結果錶明煙草屬中RGP-3基因變異豐富,而編碼的蛋白較保守,且RGP-3基因能夠較好地用于煙草繫統進化分析,這些結果為進一步研究煙草屬中RGP-3的生理功能奠定瞭基礎.
전기연구표명보통연초(N.tabacum cv.Xanthi)중부함감안산RNA결합단백기인(NtRGP-3),해기인위섭급삼투협박상관적일개중요전록후조절기인,본연구지재명학연초속불동충중RGP-3기인다양성.통과PCR동원극륭방법극륭료12개연초충중RGP-3기인,대RGP-3기인급기편마단백적결구、변이화계통진화등방면진행료분석.결과현시,RGP-3재연초속불동충중상사성개우89%~100%,기중재배연초충(N.tabacum _K326)화야생림연초(N.sylvestris)상사성위100%;다서렬비교현시,RGP-3재불동연초충중존재484개변이위점,기중외현자중변이점8.88%,내함자중변이점79.55%.3'UTR중변이점11.57%,추도적안기산부유14개변이위점,차RNA식별결구역(RRM)고도보수;계통진화분석현시,보통연아속(Tabacum)화벽동연아속(Petunioides)중RGP-3유전거리교근,이화황화연아속(Rustica)교원,여식물분류학상연초친연관계결론일치.연구결과표명연초속중RGP-3기인변이봉부,이편마적단백교보수,차RGP-3기인능구교호지용우연초계통진화분석,저사결과위진일보연구연초속중RGP-3적생리공능전정료기출.