西南农业学报
西南農業學報
서남농업학보
SOUTHWEST CHINA JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
3期
1314-1320
,共7页
陈明%罗洪林%朱佳杰%王瑞%甘西%罗永巨%李莉萍
陳明%囉洪林%硃佳傑%王瑞%甘西%囉永巨%李莉萍
진명%라홍림%주가걸%왕서%감서%라영거%리리평
吉富罗非鱼%超雄鱼%消减文库%差异基因
吉富囉非魚%超雄魚%消減文庫%差異基因
길부라비어%초웅어%소감문고%차이기인
GIFT Oreochromis niloticus%Super male tilapia%Subtractive library%Differentially expressed genes
以吉富罗非鱼YY超雄鱼和XY雄鱼的血液为试验材料,采用抑制性消减杂交技术(SSH)构建YY超雄罗非鱼和XY雄鱼的消减文库.采用PCR方法评价文库的质量后,通过DNA测序技术对204个克隆进行测序,经手动去除载体和引物序列后获得86条Contig,应用BLASTX和BioGPS程序对所获Contigs进行生物信息学分析.成功构建了吉富罗非鱼YY超雄鱼和XY雄鱼消减文库,文库库容量(CFU)为3860,库重组率为95%,所获得的DNA片段集中分布在400~ 650 bp之间.获得31条罗非鱼序列,19条非罗非鱼序列,36条序列未发现同源蛋白,可能为YY罗非鱼的新基因.对罗非鱼种属的25条差异序列进行BioGPS功能分类分析发现这些序列参与12个生物过程,可将其分为至少8个不同的分子功能群.所获序列中编码磷酸甘油酰基转移酶-4样蛋白和N-(-乙酰转移酶-10 X2同种型的基因可能与罗非鱼的性发生发育相关.进一步分析发现血红蛋白、促红细胞生成素受体样蛋白、热休克蛋白、谷光氨肽样蛋白和锌指蛋白Gfi-1B样蛋白可能在YY超雄罗非鱼抗环境温度和应激方面发挥重要作用.所构建的吉富罗非鱼YY超雄鱼和XY雄鱼消减文库质量较高,适合YY超雄罗非鱼与XY雄鱼差异基因的筛选,为今后开发YY超雄罗非鱼性别鉴定方法奠定了坚实基础.
以吉富囉非魚YY超雄魚和XY雄魚的血液為試驗材料,採用抑製性消減雜交技術(SSH)構建YY超雄囉非魚和XY雄魚的消減文庫.採用PCR方法評價文庫的質量後,通過DNA測序技術對204箇剋隆進行測序,經手動去除載體和引物序列後穫得86條Contig,應用BLASTX和BioGPS程序對所穫Contigs進行生物信息學分析.成功構建瞭吉富囉非魚YY超雄魚和XY雄魚消減文庫,文庫庫容量(CFU)為3860,庫重組率為95%,所穫得的DNA片段集中分佈在400~ 650 bp之間.穫得31條囉非魚序列,19條非囉非魚序列,36條序列未髮現同源蛋白,可能為YY囉非魚的新基因.對囉非魚種屬的25條差異序列進行BioGPS功能分類分析髮現這些序列參與12箇生物過程,可將其分為至少8箇不同的分子功能群.所穫序列中編碼燐痠甘油酰基轉移酶-4樣蛋白和N-(-乙酰轉移酶-10 X2同種型的基因可能與囉非魚的性髮生髮育相關.進一步分析髮現血紅蛋白、促紅細胞生成素受體樣蛋白、熱休剋蛋白、穀光氨肽樣蛋白和鋅指蛋白Gfi-1B樣蛋白可能在YY超雄囉非魚抗環境溫度和應激方麵髮揮重要作用.所構建的吉富囉非魚YY超雄魚和XY雄魚消減文庫質量較高,適閤YY超雄囉非魚與XY雄魚差異基因的篩選,為今後開髮YY超雄囉非魚性彆鑒定方法奠定瞭堅實基礎.
이길부라비어YY초웅어화XY웅어적혈액위시험재료,채용억제성소감잡교기술(SSH)구건YY초웅라비어화XY웅어적소감문고.채용PCR방법평개문고적질량후,통과DNA측서기술대204개극륭진행측서,경수동거제재체화인물서렬후획득86조Contig,응용BLASTX화BioGPS정서대소획Contigs진행생물신식학분석.성공구건료길부라비어YY초웅어화XY웅어소감문고,문고고용량(CFU)위3860,고중조솔위95%,소획득적DNA편단집중분포재400~ 650 bp지간.획득31조라비어서렬,19조비라비어서렬,36조서렬미발현동원단백,가능위YY라비어적신기인.대라비어충속적25조차이서렬진행BioGPS공능분류분석발현저사서렬삼여12개생물과정,가장기분위지소8개불동적분자공능군.소획서렬중편마린산감유선기전이매-4양단백화N-(-을선전이매-10 X2동충형적기인가능여라비어적성발생발육상관.진일보분석발현혈홍단백、촉홍세포생성소수체양단백、열휴극단백、곡광안태양단백화자지단백Gfi-1B양단백가능재YY초웅라비어항배경온도화응격방면발휘중요작용.소구건적길부라비어YY초웅어화XY웅어소감문고질량교고,괄합YY초웅라비어여XY웅어차이기인적사선,위금후개발YY초웅라비어성별감정방법전정료견실기출.