中国中医药科技
中國中醫藥科技
중국중의약과기
CHINESE JOURNAL OF TRADITIONAL MEDICAL SCIENCE AND TECHNOLOGY
2014年
4期
410-412
,共3页
王金权%杨杰%练成%丁维俊%李炜弘%王米渠
王金權%楊傑%練成%丁維俊%李煒弘%王米渠
왕금권%양걸%련성%정유준%리위홍%왕미거
转录组测序技术%当归%同源基因%道地药材
轉錄組測序技術%噹歸%同源基因%道地藥材
전록조측서기술%당귀%동원기인%도지약재
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目的:通过转录组测序技术全方位、深层次挖掘甘肃岷县当归的基因组资源,并进行当归同源基因分析,为当归栽培、品种鉴定、加工、配伍及保健品开发提供理论支撑.方法:岷县现场采集当归样品,并经专家鉴定为当归品种(angelica sinensis(oliv.)diels).采用RNA plant Plus方法提取岷归头、岷归尾的总RNA,质量鉴定合格后构建测序文库.测序文库检测合格后在Illummina HiSeq 2000测序仪上完成双端测序.采用相关生物信息学分析软件,实现研究目标.结果:①通过转录组测序技术,获取了63585个当归表达序列标签(EST),构建了当归的基因组.②在UniProt(date:2012.09)数据库中注释的30432个当归基因,分布于939种物种;其中序列分布频率较高的前5种物种为葡萄、蓖麻、毛果杨、大豆、苜蓿属.结论:当归基因组研究处于起步阶段,亟待深入研究.已注释基因主要分布于目前研究较深入的5种重要经济植物,成为当归制剂与保健品开发的分子生物学基础.
目的:通過轉錄組測序技術全方位、深層次挖掘甘肅岷縣噹歸的基因組資源,併進行噹歸同源基因分析,為噹歸栽培、品種鑒定、加工、配伍及保健品開髮提供理論支撐.方法:岷縣現場採集噹歸樣品,併經專傢鑒定為噹歸品種(angelica sinensis(oliv.)diels).採用RNA plant Plus方法提取岷歸頭、岷歸尾的總RNA,質量鑒定閤格後構建測序文庫.測序文庫檢測閤格後在Illummina HiSeq 2000測序儀上完成雙耑測序.採用相關生物信息學分析軟件,實現研究目標.結果:①通過轉錄組測序技術,穫取瞭63585箇噹歸錶達序列標籤(EST),構建瞭噹歸的基因組.②在UniProt(date:2012.09)數據庫中註釋的30432箇噹歸基因,分佈于939種物種;其中序列分佈頻率較高的前5種物種為葡萄、蓖痳、毛果楊、大豆、苜蓿屬.結論:噹歸基因組研究處于起步階段,亟待深入研究.已註釋基因主要分佈于目前研究較深入的5種重要經濟植物,成為噹歸製劑與保健品開髮的分子生物學基礎.
목적:통과전록조측서기술전방위、심층차알굴감숙민현당귀적기인조자원,병진행당귀동원기인분석,위당귀재배、품충감정、가공、배오급보건품개발제공이론지탱.방법:민현현장채집당귀양품,병경전가감정위당귀품충(angelica sinensis(oliv.)diels).채용RNA plant Plus방법제취민귀두、민귀미적총RNA,질량감정합격후구건측서문고.측서문고검측합격후재Illummina HiSeq 2000측서의상완성쌍단측서.채용상관생물신식학분석연건,실현연구목표.결과:①통과전록조측서기술,획취료63585개당귀표체서렬표첨(EST),구건료당귀적기인조.②재UniProt(date:2012.09)수거고중주석적30432개당귀기인,분포우939충물충;기중서렬분포빈솔교고적전5충물충위포도、비마、모과양、대두、목숙속.결론:당귀기인조연구처우기보계단,극대심입연구.이주석기인주요분포우목전연구교심입적5충중요경제식물,성위당귀제제여보건품개발적분자생물학기출.