安徽农业科学
安徽農業科學
안휘농업과학
JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
23期
7703-7709
,共7页
田玉富%崔璨%谢龙飞%李桂英%杨成君
田玉富%崔璨%謝龍飛%李桂英%楊成君
전옥부%최찬%사룡비%리계영%양성군
吉尔吉斯白桦%WRKY转录因子%生物信息学分析
吉爾吉斯白樺%WRKY轉錄因子%生物信息學分析
길이길사백화%WRKY전록인자%생물신식학분석
Betula kirghisorum%WRKY transcription factor%Bioinformatics analysis
从吉尔吉斯白桦转录组文库测序中获得白桦BkWRKY1转录因子的cDNA序列,该序列包含2 189个碱基.序列比对和同源性分析表明,该基因cDNA序列包含1 728 bp的开放阅读框,可编码575个氨基酸,5'非翻译区(UTR)为119 bp,3'非翻译区(UTR)为342bp.该基因属于WRKY transcription factor家族,含有2个WRKY结构域,蛋白分子量为62.483 kD,理论等电点为7.32,负电荷残基(Asp+ Glu)总数为62个,正电荷残基(Arg+ Lys)总数为62个.蛋白不含有信号肽,具有一定的亲水性,为亲水蛋白,无跨膜结构.同源性比较与进化树分析表明,吉尔吉斯白桦WRKY蛋白与大豆和蒺藜苜蓿的WRKY蛋白在进化上关系较近.该基因在0.6% NaHCO3胁迫处理后表达量增加,为上调表达基因.
從吉爾吉斯白樺轉錄組文庫測序中穫得白樺BkWRKY1轉錄因子的cDNA序列,該序列包含2 189箇堿基.序列比對和同源性分析錶明,該基因cDNA序列包含1 728 bp的開放閱讀框,可編碼575箇氨基痠,5'非翻譯區(UTR)為119 bp,3'非翻譯區(UTR)為342bp.該基因屬于WRKY transcription factor傢族,含有2箇WRKY結構域,蛋白分子量為62.483 kD,理論等電點為7.32,負電荷殘基(Asp+ Glu)總數為62箇,正電荷殘基(Arg+ Lys)總數為62箇.蛋白不含有信號肽,具有一定的親水性,為親水蛋白,無跨膜結構.同源性比較與進化樹分析錶明,吉爾吉斯白樺WRKY蛋白與大豆和蒺藜苜蓿的WRKY蛋白在進化上關繫較近.該基因在0.6% NaHCO3脅迫處理後錶達量增加,為上調錶達基因.
종길이길사백화전록조문고측서중획득백화BkWRKY1전록인자적cDNA서렬,해서렬포함2 189개감기.서렬비대화동원성분석표명,해기인cDNA서렬포함1 728 bp적개방열독광,가편마575개안기산,5'비번역구(UTR)위119 bp,3'비번역구(UTR)위342bp.해기인속우WRKY transcription factor가족,함유2개WRKY결구역,단백분자량위62.483 kD,이론등전점위7.32,부전하잔기(Asp+ Glu)총수위62개,정전하잔기(Arg+ Lys)총수위62개.단백불함유신호태,구유일정적친수성,위친수단백,무과막결구.동원성비교여진화수분석표명,길이길사백화WRKY단백여대두화질려목숙적WRKY단백재진화상관계교근.해기인재0.6% NaHCO3협박처리후표체량증가,위상조표체기인.