江苏农业科学
江囌農業科學
강소농업과학
JIANGSU AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
7期
28-31,32
,共5页
冯宝珍%李培谦%成娟丽%刘缙
馮寶珍%李培謙%成娟麗%劉縉
풍보진%리배겸%성연려%류진
辣椒疫霉%NPP基因家族%效应子%生物信息学
辣椒疫黴%NPP基因傢族%效應子%生物信息學
랄초역매%NPP기인가족%효응자%생물신식학
NPP( necrosis-inducing Phytophthora protein)是一类效应子,在卵菌疫霉属病原菌中普遍存在,该类蛋白能够激发植物的防御反应,如引起植物细胞死亡、促使寄主防御基因表达及产生乙烯。利用生物信息学方法对辣椒疫霉( Phytophthora capsici)基因组内的NPP基因家族存在状况进行分析,并对其氨基酸序列组成、基本理化性质、蛋白质三级结构等进行预测分析,旨在了解其结构特征,进而发掘辣椒疫霉的致病相关基因。结果表明:NPP基因家族有25个成员,其中大部分成员存在多个拷贝。对25个NPP氨基酸序列进行分析发现,其分子量在12.45~88.9 ku之间;对其中15个NPP蛋白进行三级结构预测发现,它们的三维结构类似,其主要的结构元件为α-螺旋和β-片层;构建了25个NPP蛋白的进化树,进行了分子进化分析。
NPP( necrosis-inducing Phytophthora protein)是一類效應子,在卵菌疫黴屬病原菌中普遍存在,該類蛋白能夠激髮植物的防禦反應,如引起植物細胞死亡、促使寄主防禦基因錶達及產生乙烯。利用生物信息學方法對辣椒疫黴( Phytophthora capsici)基因組內的NPP基因傢族存在狀況進行分析,併對其氨基痠序列組成、基本理化性質、蛋白質三級結構等進行預測分析,旨在瞭解其結構特徵,進而髮掘辣椒疫黴的緻病相關基因。結果錶明:NPP基因傢族有25箇成員,其中大部分成員存在多箇拷貝。對25箇NPP氨基痠序列進行分析髮現,其分子量在12.45~88.9 ku之間;對其中15箇NPP蛋白進行三級結構預測髮現,它們的三維結構類似,其主要的結構元件為α-螺鏇和β-片層;構建瞭25箇NPP蛋白的進化樹,進行瞭分子進化分析。
NPP( necrosis-inducing Phytophthora protein)시일류효응자,재란균역매속병원균중보편존재,해류단백능구격발식물적방어반응,여인기식물세포사망、촉사기주방어기인표체급산생을희。이용생물신식학방법대랄초역매( Phytophthora capsici)기인조내적NPP기인가족존재상황진행분석,병대기안기산서렬조성、기본이화성질、단백질삼급결구등진행예측분석,지재료해기결구특정,진이발굴랄초역매적치병상관기인。결과표명:NPP기인가족유25개성원,기중대부분성원존재다개고패。대25개NPP안기산서렬진행분석발현,기분자량재12.45~88.9 ku지간;대기중15개NPP단백진행삼급결구예측발현,타문적삼유결구유사,기주요적결구원건위α-라선화β-편층;구건료25개NPP단백적진화수,진행료분자진화분석。