CAJ | 학술논문

为揭示马铃薯Y病毒(Potato virus y,PVY)P1基因的分子变异及结构特征,并查明福建分离物P1基因的变异来源.文章设计一对简并引物从感染PVY的马铃薯病叶扩增、克隆获得福建分离物P1基因的cDNA全长序列,分析其核苷酸序列和氨基酸序列的特征,并采用贝叶斯法重建P1基因的系统发育树.结果显示,12个福建分离物均成功扩增出预期大小(约915 bp)的特异性片段,P1基因的核苷酸序列与已报道的PVY不同株系的核苷酸序列一致性为73％～99％; QK44,XT02,XT08,LH05分离物的309 nt位置均检测到一个强烈的重组信号.12个PVY分离物中,P1蛋白有85个变异的氨基酸位点,表明其高度变异;P1蛋白的第41～275位是一个高度保守的结构功能域,含有3个保守的活性位点(H192、D201、V235);系统发育分析显示,福建分离物形聚为3种不同的簇,其对应的卷曲结构(Coiled-coil domain)和空间结构也不相同,表明不同株系型的P1基因在系统发育关系上分化较大.该研究结果表明PVY P1基因在核苷酸序列、氨基酸序列以及空间结构具有高度变异性,但行使P1蛋白功能的活性位点所在的氨基酸(H192、D201和V235)均高度保守;福建分离物P1基因的变异源主要来自碱基突变和基因重组.
위게시마령서Y병독(Potato virus y,PVY)P1기인적분자변이급결구특정,병사명복건분리물P1기인적변이래원.문장설계일대간병인물종감염PVY적마령서병협확증、극륭획득복건분리물P1기인적cDNA전장서렬,분석기핵감산서렬화안기산서렬적특정,병채용패협사법중건P1기인적계통발육수.결과현시,12개복건분리물균성공확증출예기대소(약915 bp)적특이성편단,P1기인적핵감산서렬여이보도적PVY불동주계적핵감산서렬일치성위73％～99％; QK44,XT02,XT08,LH05분리물적309 nt위치균검측도일개강렬적중조신호.12개PVY분리물중,P1단백유85개변이적안기산위점,표명기고도변이;P1단백적제41～275위시일개고도보수적결구공능역,함유3개보수적활성위점(H192、D201、V235);계통발육분석현시,복건분리물형취위3충불동적족,기대응적권곡결구(Coiled-coil domain)화공간결구야불상동,표명불동주계형적P1기인재계통발육관계상분화교대.해연구결과표명PVY P1기인재핵감산서렬、안기산서렬이급공간결구구유고도변이성,단행사P1단백공능적활성위점소재적안기산(H192、D201화V235)균고도보수;복건분리물P1기인적변이원주요래자감기돌변화기인중조.