遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2014年
7期
697-706
,共10页
李娇%郭予琦%崔伟玲%许爱华%田曾元
李嬌%郭予琦%崔偉玲%許愛華%田曾元
리교%곽여기%최위령%허애화%전증원
玉米干旱胁迫%SR蛋白基因%表达模式%选择性剪接
玉米榦旱脅迫%SR蛋白基因%錶達模式%選擇性剪接
옥미간한협박%SR단백기인%표체모식%선택성전접
maize under drought stress%SR genes%expressional pattern%alternative splicing
基因表达的选择性剪接(Alternative splicing,AS)调控与植物对逆境胁迫应答密切相关,SR蛋白(Serine/arginine-rich proteins)是其中关键的调节因子.文章对玉米B73参考基因组进行分析显示:多数SR蛋白家族基因成员启动子区域含有3～8种与发育或胁迫相关的顺式调控元件;27个基因成员编码碱性蛋白,其中23个成员的编码蛋白依照其N '端的首个RRM(RNA recognition motif)结构域特征大体上可划分为5个亚组.利用双向分级聚类方法,对三叶期干旱胁迫下玉米杂交种郑单958及其亲本郑58和昌7-2的SR蛋白基因家族的分析显示,该基因家族的表达模式具有明显的组织表达特异性和基因型依赖性特征;其中在干旱胁迫下地下组织以下调表达模式为主,而地上组织中以上调表达模式为主.在重度干旱胁迫后的3个不同时段复水过程中,地上和地下组织中SR蛋白基因家族的表达皆以下调表达模式为主.另外,尽管不同基因成员的表达模式在干旱胁迫及其后的复水过程中存在明显差异,但普遍存在自身选择性剪接现象.SR蛋白基因家族在玉米干旱胁迫的应答规律,为从AS-network视角解析玉米的抗逆分子机制提供了新思路.
基因錶達的選擇性剪接(Alternative splicing,AS)調控與植物對逆境脅迫應答密切相關,SR蛋白(Serine/arginine-rich proteins)是其中關鍵的調節因子.文章對玉米B73參攷基因組進行分析顯示:多數SR蛋白傢族基因成員啟動子區域含有3～8種與髮育或脅迫相關的順式調控元件;27箇基因成員編碼堿性蛋白,其中23箇成員的編碼蛋白依照其N '耑的首箇RRM(RNA recognition motif)結構域特徵大體上可劃分為5箇亞組.利用雙嚮分級聚類方法,對三葉期榦旱脅迫下玉米雜交種鄭單958及其親本鄭58和昌7-2的SR蛋白基因傢族的分析顯示,該基因傢族的錶達模式具有明顯的組織錶達特異性和基因型依賴性特徵;其中在榦旱脅迫下地下組織以下調錶達模式為主,而地上組織中以上調錶達模式為主.在重度榦旱脅迫後的3箇不同時段複水過程中,地上和地下組織中SR蛋白基因傢族的錶達皆以下調錶達模式為主.另外,儘管不同基因成員的錶達模式在榦旱脅迫及其後的複水過程中存在明顯差異,但普遍存在自身選擇性剪接現象.SR蛋白基因傢族在玉米榦旱脅迫的應答規律,為從AS-network視角解析玉米的抗逆分子機製提供瞭新思路.
기인표체적선택성전접(Alternative splicing,AS)조공여식물대역경협박응답밀절상관,SR단백(Serine/arginine-rich proteins)시기중관건적조절인자.문장대옥미B73삼고기인조진행분석현시:다수SR단백가족기인성원계동자구역함유3～8충여발육혹협박상관적순식조공원건;27개기인성원편마감성단백,기중23개성원적편마단백의조기N '단적수개RRM(RNA recognition motif)결구역특정대체상가화분위5개아조.이용쌍향분급취류방법,대삼협기간한협박하옥미잡교충정단958급기친본정58화창7-2적SR단백기인가족적분석현시,해기인가족적표체모식구유명현적조직표체특이성화기인형의뢰성특정;기중재간한협박하지하조직이하조표체모식위주,이지상조직중이상조표체모식위주.재중도간한협박후적3개불동시단복수과정중,지상화지하조직중SR단백기인가족적표체개이하조표체모식위주.령외,진관불동기인성원적표체모식재간한협박급기후적복수과정중존재명현차이,단보편존재자신선택성전접현상.SR단백기인가족재옥미간한협박적응답규률,위종AS-network시각해석옥미적항역분자궤제제공료신사로.
