遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2014年
7期
691-696
,共6页
初芹%李东%侯诗宇%石万海%刘林%王雅春
初芹%李東%侯詩宇%石萬海%劉林%王雅春
초근%리동%후시우%석만해%류림%왕아춘
奶牛%DNA池%SNP标记%基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术%最小等位基因频率
奶牛%DNA池%SNP標記%基質輔助激光解析電離飛行時間質譜技術%最小等位基因頻率
내우%DNA지%SNP표기%기질보조격광해석전리비행시간질보기술%최소등위기인빈솔
dairy cattle%DNA pooling%single nuclear polymorphism%matrix-assisted laser desorption/ionisation time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS)%minor allele frequency
首先选择139个牛SNP标记,利用DNA池测序法,根据测序峰图中不同碱基信号峰高的比值确定了92个SNP为高信息量标记(比值＞1/2);为了进一步验证筛选的准确性,对其中59个标记采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(Matrix-assisted laser desorption/ionisation time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)技术检测了122头荷斯坦牛的基因型.结果显示,检出率高于85％的标记有56个,其平均最小等位基因频率(Minor allele frequency,MAF)为0.41,最小值为0.27,最大值为0.5; MAF＞0.3的标记有54个,占96.4％(54/56).文章结果表明,采用DNA池测序法筛选高信息量SNP标记是可行和可信的.
首先選擇139箇牛SNP標記,利用DNA池測序法,根據測序峰圖中不同堿基信號峰高的比值確定瞭92箇SNP為高信息量標記(比值＞1/2);為瞭進一步驗證篩選的準確性,對其中59箇標記採用基質輔助激光解析電離飛行時間質譜(Matrix-assisted laser desorption/ionisation time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)技術檢測瞭122頭荷斯坦牛的基因型.結果顯示,檢齣率高于85％的標記有56箇,其平均最小等位基因頻率(Minor allele frequency,MAF)為0.41,最小值為0.27,最大值為0.5; MAF＞0.3的標記有54箇,佔96.4％(54/56).文章結果錶明,採用DNA池測序法篩選高信息量SNP標記是可行和可信的.
수선선택139개우SNP표기,이용DNA지측서법,근거측서봉도중불동감기신호봉고적비치학정료92개SNP위고신식량표기(비치＞1/2);위료진일보험증사선적준학성,대기중59개표기채용기질보조격광해석전리비행시간질보(Matrix-assisted laser desorption/ionisation time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)기술검측료122두하사탄우적기인형.결과현시,검출솔고우85％적표기유56개,기평균최소등위기인빈솔(Minor allele frequency,MAF)위0.41,최소치위0.27,최대치위0.5; MAF＞0.3적표기유54개,점96.4％(54/56).문장결과표명,채용DNA지측서법사선고신식량SNP표기시가행화가신적.
