中国油料作物学报
中國油料作物學報
중국유료작물학보
CHINESE JOURNAL OF OIL CROP SCIENCES
2014年
5期
562-571
,共10页
柳琼%黄毅%陶章生%黄顺谋%王新发%黄邦全%刘贵华
柳瓊%黃毅%陶章生%黃順謀%王新髮%黃邦全%劉貴華
류경%황의%도장생%황순모%왕신발%황방전%류귀화
甘蓝型油菜%TFⅢA型锌指蛋白基因%基因结构%保守基序%表达模式
甘藍型油菜%TFⅢA型鋅指蛋白基因%基因結構%保守基序%錶達模式
감람형유채%TFⅢA형자지단백기인%기인결구%보수기서%표체모식
Brassica napus%TFⅢA-type zinc finger gene%Gene structure%Protein domain%Expression pattern
植物TFⅢA型锌指蛋白的锌指区含有保守的QALGGH区,属于C2H2型转录因子,参与调控植物生长发育和逆境胁迫应答.参照拟南芥AtZFP基因的C2H2结构域氨基酸序列,采用生物信息学方法鉴定了46个甘蓝型油菜TFⅢA型锌指蛋白基因,分析了基因结构、生化特性、进化关系和基因表达模式.结果表明:42个基因为单锌指蛋白基因,4个为多锌指蛋白基因;40个基因不含内含子,6个基因含内含子;46个基因的氨基酸序列同源性变幅为9.0％ ～99.2％,氨基酸序列保守性差异明显,亚类成员间包含相同的保守基序,亚类间的保守基序不同;PlantCARE分析发现其启动子区富含激素、非生物胁迫及特定生理过程响应的顺式作用元件;RNA-seq分析表明,部分基因在甘蓝型油菜品种中双11号的根、初花期雌蕊和角果中特异表达.
植物TFⅢA型鋅指蛋白的鋅指區含有保守的QALGGH區,屬于C2H2型轉錄因子,參與調控植物生長髮育和逆境脅迫應答.參照擬南芥AtZFP基因的C2H2結構域氨基痠序列,採用生物信息學方法鑒定瞭46箇甘藍型油菜TFⅢA型鋅指蛋白基因,分析瞭基因結構、生化特性、進化關繫和基因錶達模式.結果錶明:42箇基因為單鋅指蛋白基因,4箇為多鋅指蛋白基因;40箇基因不含內含子,6箇基因含內含子;46箇基因的氨基痠序列同源性變幅為9.0％ ～99.2％,氨基痠序列保守性差異明顯,亞類成員間包含相同的保守基序,亞類間的保守基序不同;PlantCARE分析髮現其啟動子區富含激素、非生物脅迫及特定生理過程響應的順式作用元件;RNA-seq分析錶明,部分基因在甘藍型油菜品種中雙11號的根、初花期雌蕊和角果中特異錶達.
식물TFⅢA형자지단백적자지구함유보수적QALGGH구,속우C2H2형전록인자,삼여조공식물생장발육화역경협박응답.삼조의남개AtZFP기인적C2H2결구역안기산서렬,채용생물신식학방법감정료46개감람형유채TFⅢA형자지단백기인,분석료기인결구、생화특성、진화관계화기인표체모식.결과표명:42개기인위단자지단백기인,4개위다자지단백기인;40개기인불함내함자,6개기인함내함자;46개기인적안기산서렬동원성변폭위9.0％ ～99.2％,안기산서렬보수성차이명현,아류성원간포함상동적보수기서,아류간적보수기서불동;PlantCARE분석발현기계동자구부함격소、비생물협박급특정생리과정향응적순식작용원건;RNA-seq분석표명,부분기인재감람형유채품충중쌍11호적근、초화기자예화각과중특이표체.
