中国医科大学学报
中國醫科大學學報
중국의과대학학보
JOURNAL OF CHINA MEDICAL UNIVERSITY
2014年
7期
625-630
,共6页
陈文标%黄建溶%彭武建%林小聪%戴勇
陳文標%黃建溶%彭武建%林小聰%戴勇
진문표%황건용%팽무건%림소총%대용
Alport综合征%小核糖核酸%GO富集%KEGG通路
Alport綜閤徵%小覈糖覈痠%GO富集%KEGG通路
Alport종합정%소핵당핵산%GO부집%KEGG통로
Alport syndrome%microRNAs%gene ontology enrichment%KEGG pathways
目的 寻找Alport综合征患者(AS)与健康对照者(NC)差异性表达小核糖核酸(microRNAs).分析差异性表达microRNAs的生物信息学特点.方法 收集AS与NC组的尿液,从尿液中分离尿肾脏管细胞,将尿肾脏管细胞诱导分化成多能干细胞(iPSCs).运用高通量测序找出2组之间差异性表达的microRNAs,用于预测特异性靶基因.靶基因可进行gene ontology(GO)富集与Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)通路信号分析.确定差异性表达的microRNAs靶基因的主要富集位点与通路信号条目.结果 在2组样本中发现30个microRNAs具有差异性表达,包括19个上调与11个下调.差异性表达microRNAs靶基因GO富集主要聚集在细胞分子、细胞组成与细胞生物学过程.嘌呤代谢通路与丝裂原激活的蛋白激酶是主要的KEGG信号传导通路.结论 差异性表达microRNAs靶基因的生物信息学可能在AS发病机制中起重要作用,可作为潜在靶点用于AS病因的深入研究.
目的 尋找Alport綜閤徵患者(AS)與健康對照者(NC)差異性錶達小覈糖覈痠(microRNAs).分析差異性錶達microRNAs的生物信息學特點.方法 收集AS與NC組的尿液,從尿液中分離尿腎髒管細胞,將尿腎髒管細胞誘導分化成多能榦細胞(iPSCs).運用高通量測序找齣2組之間差異性錶達的microRNAs,用于預測特異性靶基因.靶基因可進行gene ontology(GO)富集與Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)通路信號分析.確定差異性錶達的microRNAs靶基因的主要富集位點與通路信號條目.結果 在2組樣本中髮現30箇microRNAs具有差異性錶達,包括19箇上調與11箇下調.差異性錶達microRNAs靶基因GO富集主要聚集在細胞分子、細胞組成與細胞生物學過程.嘌呤代謝通路與絲裂原激活的蛋白激酶是主要的KEGG信號傳導通路.結論 差異性錶達microRNAs靶基因的生物信息學可能在AS髮病機製中起重要作用,可作為潛在靶點用于AS病因的深入研究.
목적 심조Alport종합정환자(AS)여건강대조자(NC)차이성표체소핵당핵산(microRNAs).분석차이성표체microRNAs적생물신식학특점.방법 수집AS여NC조적뇨액,종뇨액중분리뇨신장관세포,장뇨신장관세포유도분화성다능간세포(iPSCs).운용고통량측서조출2조지간차이성표체적microRNAs,용우예측특이성파기인.파기인가진행gene ontology(GO)부집여Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)통로신호분석.학정차이성표체적microRNAs파기인적주요부집위점여통로신호조목.결과 재2조양본중발현30개microRNAs구유차이성표체,포괄19개상조여11개하조.차이성표체microRNAs파기인GO부집주요취집재세포분자、세포조성여세포생물학과정.표령대사통로여사렬원격활적단백격매시주요적KEGG신호전도통로.결론 차이성표체microRNAs파기인적생물신식학가능재AS발병궤제중기중요작용,가작위잠재파점용우AS병인적심입연구.
