南方农业学报
南方農業學報
남방농업학보
GUANGXI AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
6期
1074-1078
,共5页
黄艳娜%李莉%何少婧%韦玲静%梁明振%兰干球%蒋钦杨
黃豔娜%李莉%何少婧%韋玲靜%樑明振%蘭榦毬%蔣欽楊
황염나%리리%하소청%위령정%량명진%란간구%장흠양
陆川猪%脂蛋白脂酶基因%克隆%序列分析%同源性%蛋白二级结构
陸川豬%脂蛋白脂酶基因%剋隆%序列分析%同源性%蛋白二級結構
륙천저%지단백지매기인%극륭%서렬분석%동원성%단백이급결구
Luchuan pig%lipoprotein lipase (LPL)gene%cloning%sequence analysis%homology%protein secondary structure
[目的]对陆川猪脂蛋白脂酶(LPL)基因进行克隆与序列分析,为后期开展LPL基因表达与陆川猪肌内脂肪沉积的相关性研究奠定基础.[方法]根据GenBank中已公布的猪LPL基因序列设计引物,以陆川猪背最长肌组织总RNA为模板,利用RT-PCR扩增其LPL基因,测序结果用Lasergene 7.0软件进行序列分析,用MEGA 6.0软件进行同源性比较及构建系统进化树,同时利用在线蛋白质结构分析软件(PMP)预测陆川猪LPL蛋白二级结构.[结果]成功克隆获得陆川猪LPL基因编码区长1437 bp,与GenBank中已公布普通猪、大白猪、杜洛克猪、通城猪、贵州白香猪的基因同源性分别为99.6％、99.7％、99.7％、99.7％和99.4％.陆川猪LPL基因第760位点存在特有的碱基A,该突变导致缬氨酸突变为蛋氨酸.由基于LPL基因碱基同源性构建的物种系统进化树可知,广西陆川猪与大白猪的遗传距离最近,其次是山羊,最远的是小鼠.蛋白二级结构预测结果表明,陆川猪的LPL蛋白二级结构包含有N-端结构域和C-端结构域两个区域,且存在PLAT/LH2.[结论]LPL基因可作为研究陆川猪脂肪沉积的主要候选基因之一.
[目的]對陸川豬脂蛋白脂酶(LPL)基因進行剋隆與序列分析,為後期開展LPL基因錶達與陸川豬肌內脂肪沉積的相關性研究奠定基礎.[方法]根據GenBank中已公佈的豬LPL基因序列設計引物,以陸川豬揹最長肌組織總RNA為模闆,利用RT-PCR擴增其LPL基因,測序結果用Lasergene 7.0軟件進行序列分析,用MEGA 6.0軟件進行同源性比較及構建繫統進化樹,同時利用在線蛋白質結構分析軟件(PMP)預測陸川豬LPL蛋白二級結構.[結果]成功剋隆穫得陸川豬LPL基因編碼區長1437 bp,與GenBank中已公佈普通豬、大白豬、杜洛剋豬、通城豬、貴州白香豬的基因同源性分彆為99.6％、99.7％、99.7％、99.7％和99.4％.陸川豬LPL基因第760位點存在特有的堿基A,該突變導緻纈氨痠突變為蛋氨痠.由基于LPL基因堿基同源性構建的物種繫統進化樹可知,廣西陸川豬與大白豬的遺傳距離最近,其次是山羊,最遠的是小鼠.蛋白二級結構預測結果錶明,陸川豬的LPL蛋白二級結構包含有N-耑結構域和C-耑結構域兩箇區域,且存在PLAT/LH2.[結論]LPL基因可作為研究陸川豬脂肪沉積的主要候選基因之一.
[목적]대륙천저지단백지매(LPL)기인진행극륭여서렬분석,위후기개전LPL기인표체여륙천저기내지방침적적상관성연구전정기출.[방법]근거GenBank중이공포적저LPL기인서렬설계인물,이륙천저배최장기조직총RNA위모판,이용RT-PCR확증기LPL기인,측서결과용Lasergene 7.0연건진행서렬분석,용MEGA 6.0연건진행동원성비교급구건계통진화수,동시이용재선단백질결구분석연건(PMP)예측륙천저LPL단백이급결구.[결과]성공극륭획득륙천저LPL기인편마구장1437 bp,여GenBank중이공포보통저、대백저、두락극저、통성저、귀주백향저적기인동원성분별위99.6％、99.7％、99.7％、99.7％화99.4％.륙천저LPL기인제760위점존재특유적감기A,해돌변도치힐안산돌변위단안산.유기우LPL기인감기동원성구건적물충계통진화수가지,엄서륙천저여대백저적유전거리최근,기차시산양,최원적시소서.단백이급결구예측결과표명,륙천저적LPL단백이급결구포함유N-단결구역화C-단결구역량개구역,차존재PLAT/LH2.[결론]LPL기인가작위연구륙천저지방침적적주요후선기인지일.
