南方农业学报
南方農業學報
남방농업학보
GUANGXI AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
7期
1276-1280
,共5页
廖玲玲%李俊%杨厚德%刘庆友%谢炳坤%崔奎青
廖玲玲%李俊%楊厚德%劉慶友%謝炳坤%崔奎青
료령령%리준%양후덕%류경우%사병곤%최규청
德保猪%RENT基因%克隆%基因功能分析%同源性%蛋白结构预测
德保豬%RENT基因%剋隆%基因功能分析%同源性%蛋白結構預測
덕보저%RENT기인%극륭%기인공능분석%동원성%단백결구예측
Debao pig%RENT%cloning%gene function analysis%homology%protein structure prediction
[目的]克隆广西德保猪抵抗素(Resistin,RENT)基因并进行系统生物信息学分析,阐明德保猪脂肪细胞分化与脂肪生成的分子机制.[方法]根据NCBI已公布的猪RENT基因序列(NM 213783.2)设计特异性引物,以从德保猪血液中提取的总RNA为模板,PCR扩增RENT基因序列,T-A克隆至pEASY-T1载体后进行测序分析,并将所得测序结果用BLAST程序、MEGA 5.0软件、EXPASY服务器、SMART程序、SignIP程序、Softberry服务器和DNASTAR软件进行生物信息学分析.[结果]扩增获得468 bp的RENT基因序列片段,包含全长的德保猪RENT基因编码区和部分非编码区序列.多重序列比较分析结果显示,德保猪RENT基因编码区核酸序列与猪、牛、山羊、绵羊、人、兔、猕猴和豚鼠的同源性分别为100.0％、85.5％、85.5％、84.5％、81.2％、80.3％、80.0％和77.3％.德保猪RENT蛋白结构预测结果显示,其理论分子质量11.69 ku,等电点7.82,为弱碱性蛋白;N-末端存在信号肽,定位于胞质外,仅具有1个低复杂度结构域,包含1个α-螺旋、8个β-折叠、7个T-转角及两个无规则卷曲.[结论]RENT基因在德保猪中呈高度保守特征,是其脂肪细胞分化中的重要调控基因.
[目的]剋隆廣西德保豬牴抗素(Resistin,RENT)基因併進行繫統生物信息學分析,闡明德保豬脂肪細胞分化與脂肪生成的分子機製.[方法]根據NCBI已公佈的豬RENT基因序列(NM 213783.2)設計特異性引物,以從德保豬血液中提取的總RNA為模闆,PCR擴增RENT基因序列,T-A剋隆至pEASY-T1載體後進行測序分析,併將所得測序結果用BLAST程序、MEGA 5.0軟件、EXPASY服務器、SMART程序、SignIP程序、Softberry服務器和DNASTAR軟件進行生物信息學分析.[結果]擴增穫得468 bp的RENT基因序列片段,包含全長的德保豬RENT基因編碼區和部分非編碼區序列.多重序列比較分析結果顯示,德保豬RENT基因編碼區覈痠序列與豬、牛、山羊、綿羊、人、兔、獼猴和豚鼠的同源性分彆為100.0％、85.5％、85.5％、84.5％、81.2％、80.3％、80.0％和77.3％.德保豬RENT蛋白結構預測結果顯示,其理論分子質量11.69 ku,等電點7.82,為弱堿性蛋白;N-末耑存在信號肽,定位于胞質外,僅具有1箇低複雜度結構域,包含1箇α-螺鏇、8箇β-摺疊、7箇T-轉角及兩箇無規則捲麯.[結論]RENT基因在德保豬中呈高度保守特徵,是其脂肪細胞分化中的重要調控基因.
[목적]극륭엄서덕보저저항소(Resistin,RENT)기인병진행계통생물신식학분석,천명덕보저지방세포분화여지방생성적분자궤제.[방법]근거NCBI이공포적저RENT기인서렬(NM 213783.2)설계특이성인물,이종덕보저혈액중제취적총RNA위모판,PCR확증RENT기인서렬,T-A극륭지pEASY-T1재체후진행측서분석,병장소득측서결과용BLAST정서、MEGA 5.0연건、EXPASY복무기、SMART정서、SignIP정서、Softberry복무기화DNASTAR연건진행생물신식학분석.[결과]확증획득468 bp적RENT기인서렬편단,포함전장적덕보저RENT기인편마구화부분비편마구서렬.다중서렬비교분석결과현시,덕보저RENT기인편마구핵산서렬여저、우、산양、면양、인、토、미후화돈서적동원성분별위100.0％、85.5％、85.5％、84.5％、81.2％、80.3％、80.0％화77.3％.덕보저RENT단백결구예측결과현시,기이론분자질량11.69 ku,등전점7.82,위약감성단백;N-말단존재신호태,정위우포질외,부구유1개저복잡도결구역,포함1개α-라선、8개β-절첩、7개T-전각급량개무규칙권곡.[결론]RENT기인재덕보저중정고도보수특정,시기지방세포분화중적중요조공기인.
