湖南工业大学学报
湖南工業大學學報
호남공업대학학보
JOURNAL OF HUNAN UNIVERSITY OF TECHNOLOGY
2014年
3期
94-98
,共5页
完全基因组%碱基间隔距离%欧氏距离%系统发育树
完全基因組%堿基間隔距離%歐氏距離%繫統髮育樹
완전기인조%감기간격거리%구씨거리%계통발육수
DNA序列的碱基间隔距离分析方法可以对完全基因组序列进行较好地分析,但是对短基因序列分析的效果不佳.因此,在碱基间隔距离的基础上,提出了一种改进的DNA序列碱基间隔距离模型,并结合欧式距离,构建了70种多瘤病毒基因组的系统发育树.通过将所得系统发育树的拓扑结构与已有文献中的结果进行对比与分析,发现所获得的结果同传统方法计算的结果基本一致,验证了所提方法的有效性.
DNA序列的堿基間隔距離分析方法可以對完全基因組序列進行較好地分析,但是對短基因序列分析的效果不佳.因此,在堿基間隔距離的基礎上,提齣瞭一種改進的DNA序列堿基間隔距離模型,併結閤歐式距離,構建瞭70種多瘤病毒基因組的繫統髮育樹.通過將所得繫統髮育樹的拓撲結構與已有文獻中的結果進行對比與分析,髮現所穫得的結果同傳統方法計算的結果基本一緻,驗證瞭所提方法的有效性.
DNA서렬적감기간격거리분석방법가이대완전기인조서렬진행교호지분석,단시대단기인서렬분석적효과불가.인차,재감기간격거리적기출상,제출료일충개진적DNA서렬감기간격거리모형,병결합구식거리,구건료70충다류병독기인조적계통발육수.통과장소득계통발육수적탁복결구여이유문헌중적결과진행대비여분석,발현소획득적결과동전통방법계산적결과기본일치,험증료소제방법적유효성.
