广东农业科学
廣東農業科學
엄동농업과학
GUANGDONG AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
16期
142-146
,共5页
甘霖%覃碧%刘实忠%王秀全%范高俊
甘霖%覃碧%劉實忠%王秀全%範高俊
감림%담벽%류실충%왕수전%범고준
橡胶树%转录组%SSR信息分析
橡膠樹%轉錄組%SSR信息分析
상효수%전록조%SSR신식분석
从NCBI网站下载橡胶树(Hevea brasiliensis)品种RRIM 600的全转录组数据(登录号:JT914190-JT981478),利用SSR软件MicroSAtellite (MISA),并采用含有1～10个碱基重复、碱基数在12 bp以上的鉴定标准对SSR基元进行鉴定分析.结果表明,从RRIM 600的全转录组数据中,共发现91 846个SSR,分布于42 859条Unigene中,发生频率为63.71％.橡胶树转录组SSR的平均长度为9 bp,平均分布频率是1/0.92 kb.其中含6个碱基重复基元类型最多,共有52 615个,占所鉴定SSR总数的57.29％.同时对这些SSR的可用性进行了评价.
從NCBI網站下載橡膠樹(Hevea brasiliensis)品種RRIM 600的全轉錄組數據(登錄號:JT914190-JT981478),利用SSR軟件MicroSAtellite (MISA),併採用含有1～10箇堿基重複、堿基數在12 bp以上的鑒定標準對SSR基元進行鑒定分析.結果錶明,從RRIM 600的全轉錄組數據中,共髮現91 846箇SSR,分佈于42 859條Unigene中,髮生頻率為63.71％.橡膠樹轉錄組SSR的平均長度為9 bp,平均分佈頻率是1/0.92 kb.其中含6箇堿基重複基元類型最多,共有52 615箇,佔所鑒定SSR總數的57.29％.同時對這些SSR的可用性進行瞭評價.
종NCBI망참하재상효수(Hevea brasiliensis)품충RRIM 600적전전록조수거(등록호:JT914190-JT981478),이용SSR연건MicroSAtellite (MISA),병채용함유1～10개감기중복、감기수재12 bp이상적감정표준대SSR기원진행감정분석.결과표명,종RRIM 600적전전록조수거중,공발현91 846개SSR,분포우42 859조Unigene중,발생빈솔위63.71％.상효수전록조SSR적평균장도위9 bp,평균분포빈솔시1/0.92 kb.기중함6개감기중복기원류형최다,공유52 615개,점소감정SSR총수적57.29％.동시대저사SSR적가용성진행료평개.
