江西农业学报
江西農業學報
강서농업학보
ACTA AGRICULTURAE JIANGXI
2014年
9期
1-5
,共5页
罗纯%吴迪%张青林%罗正荣
囉純%吳迪%張青林%囉正榮
라순%오적%장청림%라정영
柿属植物%TRAP%反应体系优化%引物筛选
柿屬植物%TRAP%反應體繫優化%引物篩選
시속식물%TRAP%반응체계우화%인물사선
Plants in Diospyros%TRAP%Reaction system optimization%Primer screening
为了建立柿属植物目标区域扩增多态性( TRAP)标记技术体系,对影响TRAP-PCR的Mg2+、dNTPs、Taq DNA聚合酶、固定引物和随机引物浓度比5个因素进行了优化。确定优化的反应体系为:模板DNA 40 ng,buffer 1×,Mg2+1.4 mmol/L,dNTPs 0.2 mmol/L,固定引物和随机引物浓度比为11∶1,Taq 酶0.5 U,反应总体积为15μL。利用柿属植物EST数据库信息设计锚定引物10条,与11条随机引物组合共110对引物。利用这些引物对柿属植物6个基因型进行TRAP-PCR扩增,其中84个引物组合能扩增出清晰条带,占引物总量的76.36%;36个引物组合表现出良好的多态性扩增,并在20份柿属植物中进行了引物验证。
為瞭建立柿屬植物目標區域擴增多態性( TRAP)標記技術體繫,對影響TRAP-PCR的Mg2+、dNTPs、Taq DNA聚閤酶、固定引物和隨機引物濃度比5箇因素進行瞭優化。確定優化的反應體繫為:模闆DNA 40 ng,buffer 1×,Mg2+1.4 mmol/L,dNTPs 0.2 mmol/L,固定引物和隨機引物濃度比為11∶1,Taq 酶0.5 U,反應總體積為15μL。利用柿屬植物EST數據庫信息設計錨定引物10條,與11條隨機引物組閤共110對引物。利用這些引物對柿屬植物6箇基因型進行TRAP-PCR擴增,其中84箇引物組閤能擴增齣清晰條帶,佔引物總量的76.36%;36箇引物組閤錶現齣良好的多態性擴增,併在20份柿屬植物中進行瞭引物驗證。
위료건립시속식물목표구역확증다태성( TRAP)표기기술체계,대영향TRAP-PCR적Mg2+、dNTPs、Taq DNA취합매、고정인물화수궤인물농도비5개인소진행료우화。학정우화적반응체계위:모판DNA 40 ng,buffer 1×,Mg2+1.4 mmol/L,dNTPs 0.2 mmol/L,고정인물화수궤인물농도비위11∶1,Taq 매0.5 U,반응총체적위15μL。이용시속식물EST수거고신식설계묘정인물10조,여11조수궤인물조합공110대인물。이용저사인물대시속식물6개기인형진행TRAP-PCR확증,기중84개인물조합능확증출청석조대,점인물총량적76.36%;36개인물조합표현출량호적다태성확증,병재20빈시속식물중진행료인물험증。
The concentrations of Mg 2+, dNTPs, Taq DNA polymerase and primers which affected TRAP ( target region ampli-fied polymorphism)-PCR reaction were optimized for the establishment of TRAP molecular marker system in Diospyros spp.The optimum reaction system was acquired as follows:template DNA 40 ng, buffer 1 ×, Mg2+1.4 mmol/L, dNTPs 0.2 mmol/L, fixed primer-arbitrary primer concentration ratio 11∶1, Taq DNA polymerase 0.5 U, and total volume of reaction system 15μL.Eighty-four TRAP primer combinations which showed robust PCR amplification in 6 persimmon genotypes were screened out from 110 primer combinations (10 fixed primers times 11 arbitrary primers).Thirty-six polymorphic primer combinations were verified in 20 persimmon genotypes .