CAJ | 학술논문

为筛选影响京海黄鸡(Gallus gallus)生长性状的单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)标记,寻找影响生长性状的关键基因,本研究利用SNP芯片分型技术,对396只京海黄鸡母鸡的15个SNPs位点直接进行SNP分型,并与京海黄鸡的12个生长指标进行关联分析,对关联分析显著的SNPs进行连锁不平衡分析和单倍型分析.结果表明,15个SNPs中,有9个与至少1个生长性状关联显著(P＜0.05);9个SNPs中有7个均与多个生长性状关联显著(P＜0.05).这些SNPs中,rs15497877、rs13972304、rs13553164、rs14917647和rs13973515与生长前期(BW2～BW8)和生长后期(BW10～BW16)的体重或日增重关联均为显著(P＜0.05),而rs316142388和rs14917305只与生长后期的体重或日增重关联显著(P＜o.05),rs314214528和rs13553485只与生长前期的体重或日增重关联显著(P＜0.05);同时,根据这些位点的群体遗传参数,发现9个SNPs的平均多态信息含量偏低,说明京海黄鸡有持续选育提高的可能性和必要性;分析9个SNP连锁不平衡性和单倍型,发现173.5～175.0Mb是一个连锁不平衡区域,具有较高的研究价值,其中,单倍型TTTCCTCAC频率达到32.4％,是十分重要的单倍型;本研究分析部分与关联显著SNPs的最近基因(核质蛋白α3(karyopherin alpha 3,KPNA3)、叉头转录因子O亚家族1(forkheadtranscription factor group O 1,FOXO1)和淋巴细胞白血病缺失7(deleted in lymphocytic leukemia 7,DLEU7))的功能,发现这些基因可以通过不同途径影响鸡的生长性状.研究结果有利于京海黄鸡乃至地方鸡种标记辅助选择的应用.
위사선영향경해황계(Gallus gallus)생장성상적단핵감산다태(single nucleotide polymorphism,SNP)표기,심조영향생장성상적관건기인,본연구이용SNP심편분형기술,대396지경해황계모계적15개SNPs위점직접진행SNP분형,병여경해황계적12개생장지표진행관련분석,대관련분석현저적SNPs진행련쇄불평형분석화단배형분석.결과표명,15개SNPs중,유9개여지소1개생장성상관련현저(P＜0.05);9개SNPs중유7개균여다개생장성상관련현저(P＜0.05).저사SNPs중,rs15497877、rs13972304、rs13553164、rs14917647화rs13973515여생장전기(BW2～BW8)화생장후기(BW10～BW16)적체중혹일증중관련균위현저(P＜0.05),이rs316142388화rs14917305지여생장후기적체중혹일증중관련현저(P＜o.05),rs314214528화rs13553485지여생장전기적체중혹일증중관련현저(P＜0.05);동시,근거저사위점적군체유전삼수,발현9개SNPs적평균다태신식함량편저,설명경해황계유지속선육제고적가능성화필요성;분석9개SNP련쇄불평형성화단배형,발현173.5～175.0Mb시일개련쇄불평형구역,구유교고적연구개치,기중,단배형TTTCCTCAC빈솔체도32.4％,시십분중요적단배형;본연구분석부분여관련현저SNPs적최근기인(핵질단백α3(karyopherin alpha 3,KPNA3)、차두전록인자O아가족1(forkheadtranscription factor group O 1,FOXO1)화림파세포백혈병결실7(deleted in lymphocytic leukemia 7,DLEU7))적공능,발현저사기인가이통과불동도경영향계적생장성상.연구결과유리우경해황계내지지방계충표기보조선택적응용.