林业科学
林業科學
임업과학
SCIENTIA SILVAE SINICAE
2014年
7期
37-43
,共7页
赵亚琦%成铁龙%施季森%王新民%徐阳%刘伟东%陈金慧
趙亞琦%成鐵龍%施季森%王新民%徐暘%劉偉東%陳金慧
조아기%성철룡%시계삼%왕신민%서양%류위동%진금혜
鹅掌楸属%SRAP%体系优化%遗传多样性
鵝掌楸屬%SRAP%體繫優化%遺傳多樣性
아장추속%SRAP%체계우화%유전다양성
Liriodendron%SRAP%system optimization%genetic diversity
采用L16(45)正交设计,对鹅掌楸属SRAP-PCR反应的5个因素(Mg2+、dNTPs、引物、Taq酶和模板DNA浓度)在4个水平上进行优化试验,同时对SRAP反应影响较大的Mg2+、Taq酶、模板DNA浓度进行单因素分析.建立鹅掌楸属植物SRAP-PCR最适反应体系(20 μL),反应条件为:Mg2+ 3.0 mmol·L-1,dNTPs 0.3mmol·L-1,引物浓度0.9 μmol·L-1,Taq酶2.0 μmol· min-1,模板DNA 90 ng,10×PCR buffer 2 μL,不足部分以ddH2O补足.利用优化的SRAP体系对鹅掌楸属10个不同地理种源进行遗传多样性分析.筛选出15对条带清晰、多态性高的引物共扩增出182个位点,其中149个为多态性位点,多态性比例为81.87％.应用POPGEN 32软件通过UPGMA法进行聚类分析,从聚类图可以看出10个地理种源间的遗传距离及亲缘关系,表明SRAP分子标记可以运用于鹅掌楸属的遗传多样性研究.
採用L16(45)正交設計,對鵝掌楸屬SRAP-PCR反應的5箇因素(Mg2+、dNTPs、引物、Taq酶和模闆DNA濃度)在4箇水平上進行優化試驗,同時對SRAP反應影響較大的Mg2+、Taq酶、模闆DNA濃度進行單因素分析.建立鵝掌楸屬植物SRAP-PCR最適反應體繫(20 μL),反應條件為:Mg2+ 3.0 mmol·L-1,dNTPs 0.3mmol·L-1,引物濃度0.9 μmol·L-1,Taq酶2.0 μmol· min-1,模闆DNA 90 ng,10×PCR buffer 2 μL,不足部分以ddH2O補足.利用優化的SRAP體繫對鵝掌楸屬10箇不同地理種源進行遺傳多樣性分析.篩選齣15對條帶清晰、多態性高的引物共擴增齣182箇位點,其中149箇為多態性位點,多態性比例為81.87％.應用POPGEN 32軟件通過UPGMA法進行聚類分析,從聚類圖可以看齣10箇地理種源間的遺傳距離及親緣關繫,錶明SRAP分子標記可以運用于鵝掌楸屬的遺傳多樣性研究.
채용L16(45)정교설계,대아장추속SRAP-PCR반응적5개인소(Mg2+、dNTPs、인물、Taq매화모판DNA농도)재4개수평상진행우화시험,동시대SRAP반응영향교대적Mg2+、Taq매、모판DNA농도진행단인소분석.건립아장추속식물SRAP-PCR최괄반응체계(20 μL),반응조건위:Mg2+ 3.0 mmol·L-1,dNTPs 0.3mmol·L-1,인물농도0.9 μmol·L-1,Taq매2.0 μmol· min-1,모판DNA 90 ng,10×PCR buffer 2 μL,불족부분이ddH2O보족.이용우화적SRAP체계대아장추속10개불동지리충원진행유전다양성분석.사선출15대조대청석、다태성고적인물공확증출182개위점,기중149개위다태성위점,다태성비례위81.87％.응용POPGEN 32연건통과UPGMA법진행취류분석,종취류도가이간출10개지리충원간적유전거리급친연관계,표명SRAP분자표기가이운용우아장추속적유전다양성연구.
