计算机与应用化学
計算機與應用化學
계산궤여응용화학
COMPUTERS AND APPLIED CHEMISTRY
2014年
7期
825-828
,共4页
沈婷婷%王四华%孟菲%张光亚
瀋婷婷%王四華%孟菲%張光亞
침정정%왕사화%맹비%장광아
苹果酸脱氢酶%嗜热酶%嗜冷酶%分子动力学模拟%盐桥
蘋果痠脫氫酶%嗜熱酶%嗜冷酶%分子動力學模擬%鹽橋
평과산탈경매%기열매%기랭매%분자동역학모의%염교
malate dehydrogenase%thermophilic enzyme%psychrophilic enzymes%molecular dynamics simulation%salt bridge
为了研究嗜热酶、嗜冷酶在极端温度下维持稳定性和活性的机制,本文通过分子动力学模拟的方法,从原子尺度上分析了嗜热苹果酸脱氢酶及其同源嗜冷酶的分子动力学特性.数据显示嗜热酶所形成的盐桥和氢键明显多于嗜冷酶.通过比较均方根偏差、回旋半径、氨基酸残基的柔性等值,发现嗜热酶的结构较非嗜热酶更具刚性.盐桥、氢键数目的不同和整体结构的刚柔性,很可能会是嗜热、嗜冷酶在极端温度下能维持结构稳定的主要原因.
為瞭研究嗜熱酶、嗜冷酶在極耑溫度下維持穩定性和活性的機製,本文通過分子動力學模擬的方法,從原子呎度上分析瞭嗜熱蘋果痠脫氫酶及其同源嗜冷酶的分子動力學特性.數據顯示嗜熱酶所形成的鹽橋和氫鍵明顯多于嗜冷酶.通過比較均方根偏差、迴鏇半徑、氨基痠殘基的柔性等值,髮現嗜熱酶的結構較非嗜熱酶更具剛性.鹽橋、氫鍵數目的不同和整體結構的剛柔性,很可能會是嗜熱、嗜冷酶在極耑溫度下能維持結構穩定的主要原因.
위료연구기열매、기랭매재겁단온도하유지은정성화활성적궤제,본문통과분자동역학모의적방법,종원자척도상분석료기열평과산탈경매급기동원기랭매적분자동역학특성.수거현시기열매소형성적염교화경건명현다우기랭매.통과비교균방근편차、회선반경、안기산잔기적유성등치,발현기열매적결구교비기열매경구강성.염교、경건수목적불동화정체결구적강유성,흔가능회시기열、기랭매재겁단온도하능유지결구은정적주요원인.
