贵阳医学院学报
貴暘醫學院學報
귀양의학원학보
JOURNAL OF GUIYANG MEDICAL COLLEGE
2014年
4期
470-474
,共5页
裘学丽%国果%吴沁怡%赵学军%付萍%张勇%吴建伟
裘學麗%國果%吳沁怡%趙學軍%付萍%張勇%吳建偉
구학려%국과%오심이%조학군%부평%장용%오건위
家蝇%围食膜蛋白%黏蛋白%序列分析%蛋白质结构,二级
傢蠅%圍食膜蛋白%黏蛋白%序列分析%蛋白質結構,二級
가승%위식막단백%점단백%서렬분석%단백질결구,이급
houseflies%peritrophic membrane protein%mucin%sequence analysis%protein stracture,secondary
目的:分析和预测家蝇黏蛋白mucin-46基因及其编码蛋白的结构和特性.方法:利用EST测序技术从家蝇幼虫cDNA文库中获得家蝇黏蛋白mucin-46基因cDNA序列,采用美国国家生物技术信息中心(NCBI)、瑞士生物信息学研究所的蛋白分析专家系统(Expasy)中的相关工具,对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构和亚细胞定位等方面进行预测和分析.结果:家蝇黏蛋白mucin-46基因的cDNA序列具有完整的开放阅读框(ORF),全长1 383 bp,编码460个氨基酸;其编码的蛋白质理论分子量为46.42 kDa,等电点4.13;无信号肽及跨膜区,属于亲水性蛋白,具有4个几丁质结合功能域,含有4个糖基化位点及多个蛋白磷酸化作用位点;二级结构β折叠(E)和无规则卷曲(L)的比例是14.13∶85.87,没有α螺旋(H)结构类型;主要分布于细胞核.结论:应用生物信息学方法从家蝇cDNA文库中筛选出了家蝇黏蛋白mucin-46基因序列并预测了其结构及功能等生物学信息,为进一步研究家蝇围食膜蛋白的功能奠定了一定的基础.
目的:分析和預測傢蠅黏蛋白mucin-46基因及其編碼蛋白的結構和特性.方法:利用EST測序技術從傢蠅幼蟲cDNA文庫中穫得傢蠅黏蛋白mucin-46基因cDNA序列,採用美國國傢生物技術信息中心(NCBI)、瑞士生物信息學研究所的蛋白分析專傢繫統(Expasy)中的相關工具,對該基因及其編碼蛋白的基本理化性質、疏水性、信號肽、二級結構和亞細胞定位等方麵進行預測和分析.結果:傢蠅黏蛋白mucin-46基因的cDNA序列具有完整的開放閱讀框(ORF),全長1 383 bp,編碼460箇氨基痠;其編碼的蛋白質理論分子量為46.42 kDa,等電點4.13;無信號肽及跨膜區,屬于親水性蛋白,具有4箇幾丁質結閤功能域,含有4箇糖基化位點及多箇蛋白燐痠化作用位點;二級結構β摺疊(E)和無規則捲麯(L)的比例是14.13∶85.87,沒有α螺鏇(H)結構類型;主要分佈于細胞覈.結論:應用生物信息學方法從傢蠅cDNA文庫中篩選齣瞭傢蠅黏蛋白mucin-46基因序列併預測瞭其結構及功能等生物學信息,為進一步研究傢蠅圍食膜蛋白的功能奠定瞭一定的基礎.
목적:분석화예측가승점단백mucin-46기인급기편마단백적결구화특성.방법:이용EST측서기술종가승유충cDNA문고중획득가승점단백mucin-46기인cDNA서렬,채용미국국가생물기술신식중심(NCBI)、서사생물신식학연구소적단백분석전가계통(Expasy)중적상관공구,대해기인급기편마단백적기본이화성질、소수성、신호태、이급결구화아세포정위등방면진행예측화분석.결과:가승점단백mucin-46기인적cDNA서렬구유완정적개방열독광(ORF),전장1 383 bp,편마460개안기산;기편마적단백질이론분자량위46.42 kDa,등전점4.13;무신호태급과막구,속우친수성단백,구유4개궤정질결합공능역,함유4개당기화위점급다개단백린산화작용위점;이급결구β절첩(E)화무규칙권곡(L)적비례시14.13∶85.87,몰유α라선(H)결구류형;주요분포우세포핵.결론:응용생물신식학방법종가승cDNA문고중사선출료가승점단백mucin-46기인서렬병예측료기결구급공능등생물학신식,위진일보연구가승위식막단백적공능전정료일정적기출.
