江苏农业科学
江囌農業科學
강소농업과학
JIANGSU AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
9期
26-29
,共4页
陈希文%赖守勋%李莲%叶兆美%蒋清蓉%代友洪%陈思军
陳希文%賴守勛%李蓮%葉兆美%蔣清蓉%代友洪%陳思軍
진희문%뢰수훈%리련%협조미%장청용%대우홍%진사군
绵阳%猪繁殖与呼吸综合征%ORF5基因%克隆%遗传变异
綿暘%豬繁殖與呼吸綜閤徵%ORF5基因%剋隆%遺傳變異
면양%저번식여호흡종합정%ORF5기인%극륭%유전변이
采用RT-PCR方法对四川绵阳地区采集的疑似猪繁殖与呼吸综合征感染病料进行克隆,并对ORF5基因进行测序及遗传进化分析。 Nsp2基因扩增结果表明,获得的15个猪繁殖与呼吸综合征阳性毒株均为Nsp2基因存在缺失的变异株。 ORF5基因测序结果表明,15株ORF5基因均由603 bp编码、200个氨基酸组成,各毒株之间的氨基酸同源性为87.6%~100.0%,与GenBank 中13株参考毒株的序列同源性在57.2%~99.0%之间,与HUN4、JXA1、TJM、GXHZ12等HP-PRRSV代表株ORF5的相似性高达90%~99%。推导氨基酸分析结果表明,各毒株的ORF5氨基酸序列因各场的不同而差异显著,存在一些突变位点,同时同一场内的不同毒株间的差异也较大,多数毒株在信号肽、跨膜功能区都存在突变位点,各毒株的潜在糖基化位点也存在差异;遗传进化树分析结果表明,15株ORF5序列均属于北美株,大部分毒株序列与2006年暴发的JXA1高度同源。总体上,各毒株之间没有呈现明显的地域性。
採用RT-PCR方法對四川綿暘地區採集的疑似豬繁殖與呼吸綜閤徵感染病料進行剋隆,併對ORF5基因進行測序及遺傳進化分析。 Nsp2基因擴增結果錶明,穫得的15箇豬繁殖與呼吸綜閤徵暘性毒株均為Nsp2基因存在缺失的變異株。 ORF5基因測序結果錶明,15株ORF5基因均由603 bp編碼、200箇氨基痠組成,各毒株之間的氨基痠同源性為87.6%~100.0%,與GenBank 中13株參攷毒株的序列同源性在57.2%~99.0%之間,與HUN4、JXA1、TJM、GXHZ12等HP-PRRSV代錶株ORF5的相似性高達90%~99%。推導氨基痠分析結果錶明,各毒株的ORF5氨基痠序列因各場的不同而差異顯著,存在一些突變位點,同時同一場內的不同毒株間的差異也較大,多數毒株在信號肽、跨膜功能區都存在突變位點,各毒株的潛在糖基化位點也存在差異;遺傳進化樹分析結果錶明,15株ORF5序列均屬于北美株,大部分毒株序列與2006年暴髮的JXA1高度同源。總體上,各毒株之間沒有呈現明顯的地域性。
채용RT-PCR방법대사천면양지구채집적의사저번식여호흡종합정감염병료진행극륭,병대ORF5기인진행측서급유전진화분석。 Nsp2기인확증결과표명,획득적15개저번식여호흡종합정양성독주균위Nsp2기인존재결실적변이주。 ORF5기인측서결과표명,15주ORF5기인균유603 bp편마、200개안기산조성,각독주지간적안기산동원성위87.6%~100.0%,여GenBank 중13주삼고독주적서렬동원성재57.2%~99.0%지간,여HUN4、JXA1、TJM、GXHZ12등HP-PRRSV대표주ORF5적상사성고체90%~99%。추도안기산분석결과표명,각독주적ORF5안기산서렬인각장적불동이차이현저,존재일사돌변위점,동시동일장내적불동독주간적차이야교대,다수독주재신호태、과막공능구도존재돌변위점,각독주적잠재당기화위점야존재차이;유전진화수분석결과표명,15주ORF5서렬균속우북미주,대부분독주서렬여2006년폭발적JXA1고도동원。총체상,각독주지간몰유정현명현적지역성。