农业资源与环境学报
農業資源與環境學報
농업자원여배경학보
Journal of Agricultural Resources and Environment
2014年
5期
470-475
,共6页
杜东霞%尹红梅%张德元%刘标%许隽%王震%贺月林
杜東霞%尹紅梅%張德元%劉標%許雋%王震%賀月林
두동하%윤홍매%장덕원%류표%허준%왕진%하월림
发酵床垫料%16S rDNA%单因素法%退火温度
髮酵床墊料%16S rDNA%單因素法%退火溫度
발효상점료%16S rDNA%단인소법%퇴화온도
fermentation bed padding material%16S rDNA%single factor experiment%annealing temperature
为探讨发酵床垫料中微生物16S rDNA基因扩增实验中诸多因素对实验结果的影响,采用单因素法对16S rDNA基因扩增时PCR反应体系中的5个潜在因素(Mg2+、dNTP、引物、Taq酶、模板DNA)5水平上进行优化实验,并进一步优化了反应程序中的退火温度、循环次数。结果表明:25μL的最佳反应体系为:10×PCR buffer 2.5μL、MgCl22.0 mmol·L-1、dNTP 0.2 mmol·L-1、引物0.2μmol·L-1、Taq DNA聚合酶0.5 U、模板DNA 50 ng;最佳反应程序为:在94℃下进行4 min预变性;随后循环扩增25个循环(包括94℃变性45 s,53.7℃退火30 s,72℃延伸90 s);最后在72℃下延伸10 min。
為探討髮酵床墊料中微生物16S rDNA基因擴增實驗中諸多因素對實驗結果的影響,採用單因素法對16S rDNA基因擴增時PCR反應體繫中的5箇潛在因素(Mg2+、dNTP、引物、Taq酶、模闆DNA)5水平上進行優化實驗,併進一步優化瞭反應程序中的退火溫度、循環次數。結果錶明:25μL的最佳反應體繫為:10×PCR buffer 2.5μL、MgCl22.0 mmol·L-1、dNTP 0.2 mmol·L-1、引物0.2μmol·L-1、Taq DNA聚閤酶0.5 U、模闆DNA 50 ng;最佳反應程序為:在94℃下進行4 min預變性;隨後循環擴增25箇循環(包括94℃變性45 s,53.7℃退火30 s,72℃延伸90 s);最後在72℃下延伸10 min。
위탐토발효상점료중미생물16S rDNA기인확증실험중제다인소대실험결과적영향,채용단인소법대16S rDNA기인확증시PCR반응체계중적5개잠재인소(Mg2+、dNTP、인물、Taq매、모판DNA)5수평상진행우화실험,병진일보우화료반응정서중적퇴화온도、순배차수。결과표명:25μL적최가반응체계위:10×PCR buffer 2.5μL、MgCl22.0 mmol·L-1、dNTP 0.2 mmol·L-1、인물0.2μmol·L-1、Taq DNA취합매0.5 U、모판DNA 50 ng;최가반응정서위:재94℃하진행4 min예변성;수후순배확증25개순배(포괄94℃변성45 s,53.7℃퇴화30 s,72℃연신90 s);최후재72℃하연신10 min。
In order to study the influence of several potential factors on 16S rDNA PCR reaction conditions in fermentation bed padding mate-rial, five factors(Mg2+, dNTP, primer, Taq DNA polymerase and DNA template)were optimized by single factor experiment at 5 concentration levels. Annealing temperatures and amplification cycle numbers were also optimized. The results showed that the optimum 25 μL reaction system comprised 10 ×PCR buffer 25μL, MgCl2 2.0 mmol·L-1, dNTP 0.2 mmol·L-1, primer 0.2μmol·L-1, Taq DNA polymerase 0.5 U and DNA template 50 ng;and the optimum PCR procedure was as an initial pre-denaturing at 94℃for 4 min, which preceded 25 cycles of dena-turing at 94℃for 45 s, annealing at 53.7℃for 30 s, and extension at 72℃for 90 s, with a final extension at 72℃for 10 min.