棉花学报
棉花學報
면화학보
COTTON SCIENCE
2014年
5期
420-430
,共11页
郭志军%赵云雷%陈伟%李运海%王红梅%龚海燕%桑晓慧
郭誌軍%趙雲雷%陳偉%李運海%王紅梅%龔海燕%桑曉慧
곽지군%조운뢰%진위%리운해%왕홍매%공해연%상효혜
陆地棉%关联分析%SSR%遗传多样性%群体结构
陸地棉%關聯分析%SSR%遺傳多樣性%群體結構
륙지면%관련분석%SSR%유전다양성%군체결구
upland cotton%associate analysis%SSR%genetic diversity%population structure
分析陆地棉栽培种遗传多样性,通过关联分析寻找与棉花农艺性状相关联的分子标记,为分子标记辅助选择育种和提高棉花育种效率奠定基础.本文采用74个Simple sequence repeat(SSR)标记对172份陆地棉栽培种的基因组变异进行扫描,使用NTSYS-pc 2.20进行聚类,分析该群体遗传多样性;利用Structure 2.3.4软件分析群体结构,在此基础上结合田间表型数据,采用Tassel 2.1的一般线性模型(General linear model,GLM)进行关联分析,定位与农艺性状相关的QTLs.74个标记共检测到148个多态性位点,涉及246个等位变异,变异范围2~7个,平均等位变异数为3.32;引物的多态性信息含量(PIC)为0.0281~0.3733,平均值为0.2370;遗传相似系数变异在0.2816~1,平均值为0 5369,平均遗传相似系数为0 5369,表明我国陆地棉遗传基础狭窄,尽管国外及西北内陆棉区部分材料具有较丰富的遗传变异.聚类分析将该群体划分为12个亚群,不同棉区的材料交叉分布,且聚类结果基本与系谱吻合.群体结构分析却将172份供试材料划分为3个亚群;通过关联分析,发现30个位点与铃重、衣分、黄萎病抗性显著相关(P<0 05),各位点对表型变异贡献率为2.24%~5.27%.
分析陸地棉栽培種遺傳多樣性,通過關聯分析尋找與棉花農藝性狀相關聯的分子標記,為分子標記輔助選擇育種和提高棉花育種效率奠定基礎.本文採用74箇Simple sequence repeat(SSR)標記對172份陸地棉栽培種的基因組變異進行掃描,使用NTSYS-pc 2.20進行聚類,分析該群體遺傳多樣性;利用Structure 2.3.4軟件分析群體結構,在此基礎上結閤田間錶型數據,採用Tassel 2.1的一般線性模型(General linear model,GLM)進行關聯分析,定位與農藝性狀相關的QTLs.74箇標記共檢測到148箇多態性位點,涉及246箇等位變異,變異範圍2~7箇,平均等位變異數為3.32;引物的多態性信息含量(PIC)為0.0281~0.3733,平均值為0.2370;遺傳相似繫數變異在0.2816~1,平均值為0 5369,平均遺傳相似繫數為0 5369,錶明我國陸地棉遺傳基礎狹窄,儘管國外及西北內陸棉區部分材料具有較豐富的遺傳變異.聚類分析將該群體劃分為12箇亞群,不同棉區的材料交扠分佈,且聚類結果基本與繫譜吻閤.群體結構分析卻將172份供試材料劃分為3箇亞群;通過關聯分析,髮現30箇位點與鈴重、衣分、黃萎病抗性顯著相關(P<0 05),各位點對錶型變異貢獻率為2.24%~5.27%.
분석륙지면재배충유전다양성,통과관련분석심조여면화농예성상상관련적분자표기,위분자표기보조선택육충화제고면화육충효솔전정기출.본문채용74개Simple sequence repeat(SSR)표기대172빈륙지면재배충적기인조변이진행소묘,사용NTSYS-pc 2.20진행취류,분석해군체유전다양성;이용Structure 2.3.4연건분석군체결구,재차기출상결합전간표형수거,채용Tassel 2.1적일반선성모형(General linear model,GLM)진행관련분석,정위여농예성상상관적QTLs.74개표기공검측도148개다태성위점,섭급246개등위변이,변이범위2~7개,평균등위변이수위3.32;인물적다태성신식함량(PIC)위0.0281~0.3733,평균치위0.2370;유전상사계수변이재0.2816~1,평균치위0 5369,평균유전상사계수위0 5369,표명아국륙지면유전기출협착,진관국외급서북내륙면구부분재료구유교봉부적유전변이.취류분석장해군체화분위12개아군,불동면구적재료교차분포,차취류결과기본여계보문합.군체결구분석각장172빈공시재료화분위3개아군;통과관련분석,발현30개위점여령중、의분、황위병항성현저상관(P<0 05),각위점대표형변이공헌솔위2.24%~5.27%.