棉花学报
棉花學報
면화학보
COTTON SCIENCE
2014年
5期
411-419
,共9页
刘国元%吴嫚%于霁雯%裴文锋%喻树迅
劉國元%吳嫚%于霽雯%裴文鋒%喻樹迅
류국원%오만%우제문%배문봉%유수신
雷蒙德氏棉%AGO基因家族%基因结构%表达模式
雷矇德氏棉%AGO基因傢族%基因結構%錶達模式
뢰몽덕씨면%AGO기인가족%기인결구%표체모식
G.raimondii%AGO gene family%gene structure%expression pattern
Argonaute(AGO)蛋白是参与小RNA调控通路的重要元件,在生命体的生长发育过程中发挥着重要作用.本研究利用AGO蛋白的保守域在雷蒙德氏棉基因组中进行同源比对,鉴定出15个成员,并对其进行进化关系、染色体定位、基因结构、保守域、时空表达模式等分析.结果表明:该家族成员基因长度从3335到9086bp不等,其中11个基因被定位到7条染色体上;该家族成员可分为3个亚族,包含5个小组,各亚族内、小组间成员也存在很高的保守性;发现每个基因都有不同的时空表达模式,且各小组内成员之间存在协同和互补2种表达模式,找到在花器官特异表达的基因1个,胚珠中特异表达的基因3个.本文首次对棉花中AGO基因家族进行了鉴定和生物信息学分析,为进一步研究AGO基因家族在棉花中的功能奠定了基础.
Argonaute(AGO)蛋白是參與小RNA調控通路的重要元件,在生命體的生長髮育過程中髮揮著重要作用.本研究利用AGO蛋白的保守域在雷矇德氏棉基因組中進行同源比對,鑒定齣15箇成員,併對其進行進化關繫、染色體定位、基因結構、保守域、時空錶達模式等分析.結果錶明:該傢族成員基因長度從3335到9086bp不等,其中11箇基因被定位到7條染色體上;該傢族成員可分為3箇亞族,包含5箇小組,各亞族內、小組間成員也存在很高的保守性;髮現每箇基因都有不同的時空錶達模式,且各小組內成員之間存在協同和互補2種錶達模式,找到在花器官特異錶達的基因1箇,胚珠中特異錶達的基因3箇.本文首次對棉花中AGO基因傢族進行瞭鑒定和生物信息學分析,為進一步研究AGO基因傢族在棉花中的功能奠定瞭基礎.
Argonaute(AGO)단백시삼여소RNA조공통로적중요원건,재생명체적생장발육과정중발휘착중요작용.본연구이용AGO단백적보수역재뢰몽덕씨면기인조중진행동원비대,감정출15개성원,병대기진행진화관계、염색체정위、기인결구、보수역、시공표체모식등분석.결과표명:해가족성원기인장도종3335도9086bp불등,기중11개기인피정위도7조염색체상;해가족성원가분위3개아족,포함5개소조,각아족내、소조간성원야존재흔고적보수성;발현매개기인도유불동적시공표체모식,차각소조내성원지간존재협동화호보2충표체모식,조도재화기관특이표체적기인1개,배주중특이표체적기인3개.본문수차대면화중AGO기인가족진행료감정화생물신식학분석,위진일보연구AGO기인가족재면화중적공능전정료기출.
