遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2014年
9期
921-933
,共13页
张毓婷%王敏华%陈家栋%戎均康%丁明全
張毓婷%王敏華%陳傢棟%戎均康%丁明全
장육정%왕민화%진가동%융균강%정명전
棉纤维%HSP70家族%深度测序%基因结构%系统进化分析
棉纖維%HSP70傢族%深度測序%基因結構%繫統進化分析
면섬유%HSP70가족%심도측서%기인결구%계통진화분석
cotton fiber%HSP70 family%deep sequencing%gene structure%phylogenic analysis
热激蛋白70家族(HSP70)是一类在植物中高度保守的分子伴侣蛋白,在细胞中协助蛋白质正确折叠.文章利用隐马可链夫模型(HMM)在雷蒙德氏棉(Gossypium raimondiiL.)全基因组范围内进行HSP70基因家族成员进化分析,共得到30个HSP70家族成员.利用生物信息学对雷蒙德氏棉HSP70基因的结构、染色体分布、基因倍增模式以及系统进化进行分析,结果表明,HSP70基因家族根据亚细胞定位结果可分为不同的基因亚家族,各亚家族中HSP70基因具有相对保守的基因结构;染色体片段重复和串联重复是雷蒙德氏棉HSP70基因家族扩增的主要方式.通过对不同物种的HSP70基因家族进行系统进化分析可知,HSP70亚组的分化发生在单细胞植物形成前,且细胞质型HSP70成员大量扩增.比较陆地棉棉纤维发育不同时期的深度测序表达谱,发现HSP70基因可能参与棉纤维的生长发育.本研究结果有助于了解棉属植物HSP70基因家族的功能,以期为深入研究棉纤维发育过程中的分子调控机理提供基础.
熱激蛋白70傢族(HSP70)是一類在植物中高度保守的分子伴侶蛋白,在細胞中協助蛋白質正確摺疊.文章利用隱馬可鏈伕模型(HMM)在雷矇德氏棉(Gossypium raimondiiL.)全基因組範圍內進行HSP70基因傢族成員進化分析,共得到30箇HSP70傢族成員.利用生物信息學對雷矇德氏棉HSP70基因的結構、染色體分佈、基因倍增模式以及繫統進化進行分析,結果錶明,HSP70基因傢族根據亞細胞定位結果可分為不同的基因亞傢族,各亞傢族中HSP70基因具有相對保守的基因結構;染色體片段重複和串聯重複是雷矇德氏棉HSP70基因傢族擴增的主要方式.通過對不同物種的HSP70基因傢族進行繫統進化分析可知,HSP70亞組的分化髮生在單細胞植物形成前,且細胞質型HSP70成員大量擴增.比較陸地棉棉纖維髮育不同時期的深度測序錶達譜,髮現HSP70基因可能參與棉纖維的生長髮育.本研究結果有助于瞭解棉屬植物HSP70基因傢族的功能,以期為深入研究棉纖維髮育過程中的分子調控機理提供基礎.
열격단백70가족(HSP70)시일류재식물중고도보수적분자반려단백,재세포중협조단백질정학절첩.문장이용은마가련부모형(HMM)재뢰몽덕씨면(Gossypium raimondiiL.)전기인조범위내진행HSP70기인가족성원진화분석,공득도30개HSP70가족성원.이용생물신식학대뢰몽덕씨면HSP70기인적결구、염색체분포、기인배증모식이급계통진화진행분석,결과표명,HSP70기인가족근거아세포정위결과가분위불동적기인아가족,각아가족중HSP70기인구유상대보수적기인결구;염색체편단중복화천련중복시뢰몽덕씨면HSP70기인가족확증적주요방식.통과대불동물충적HSP70기인가족진행계통진화분석가지,HSP70아조적분화발생재단세포식물형성전,차세포질형HSP70성원대량확증.비교륙지면면섬유발육불동시기적심도측서표체보,발현HSP70기인가능삼여면섬유적생장발육.본연구결과유조우료해면속식물HSP70기인가족적공능,이기위심입연구면섬유발육과정중적분자조공궤리제공기출.
