遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2014年
9期
912-920
,共9页
海南山鹧鸪%线粒体基因组%比较基因组学%系统发育
海南山鷓鴣%線粒體基因組%比較基因組學%繫統髮育
해남산자고%선립체기인조%비교기인조학%계통발육
Arborophila ardens%mitochondrial genome%comparative genomics%phylogeny
海南山鹧鸪(Arborophila ardens)对生境选择比较严格,种群数量稀少,属于濒危物种.为进一步研究山鹧鸪属的进化和系统发育关系,文章利用Illumina Hiseq2000高通量测序技术获得了海南山鹧鸪线粒体全基因组序列,从比较基因组学角度分析了4种山鹧鸪鸟类的线粒体基因组特征,并探讨了山鹧鸪属鸟类的系统发育地位.研究结果表明:(1)海南山鹧鸪线粒体基因组长度为16 730 bp,编码13个蛋白质编码基因、2个核糖体RNA基因、22个转运RNA基因以及1个控制区;(2)山鹧鸪属物种受到了纯化选择的作用,且在进化过程中积累了更多的非同义替换;(3)山鹧鸪属位于雉科鸟类系统树的基部位置,其中白眉山鹧鸪与红喉山鹧鸪互为姐妹群,海南山鹧鸪位于山鹧鸪属的基部位置,与其他3种山鹧鸪鸟类的亲缘关系较远.
海南山鷓鴣(Arborophila ardens)對生境選擇比較嚴格,種群數量稀少,屬于瀕危物種.為進一步研究山鷓鴣屬的進化和繫統髮育關繫,文章利用Illumina Hiseq2000高通量測序技術穫得瞭海南山鷓鴣線粒體全基因組序列,從比較基因組學角度分析瞭4種山鷓鴣鳥類的線粒體基因組特徵,併探討瞭山鷓鴣屬鳥類的繫統髮育地位.研究結果錶明:(1)海南山鷓鴣線粒體基因組長度為16 730 bp,編碼13箇蛋白質編碼基因、2箇覈糖體RNA基因、22箇轉運RNA基因以及1箇控製區;(2)山鷓鴣屬物種受到瞭純化選擇的作用,且在進化過程中積纍瞭更多的非同義替換;(3)山鷓鴣屬位于雉科鳥類繫統樹的基部位置,其中白眉山鷓鴣與紅喉山鷓鴣互為姐妹群,海南山鷓鴣位于山鷓鴣屬的基部位置,與其他3種山鷓鴣鳥類的親緣關繫較遠.
해남산자고(Arborophila ardens)대생경선택비교엄격,충군수량희소,속우빈위물충.위진일보연구산자고속적진화화계통발육관계,문장이용Illumina Hiseq2000고통량측서기술획득료해남산자고선립체전기인조서렬,종비교기인조학각도분석료4충산자고조류적선립체기인조특정,병탐토료산자고속조류적계통발육지위.연구결과표명:(1)해남산자고선립체기인조장도위16 730 bp,편마13개단백질편마기인、2개핵당체RNA기인、22개전운RNA기인이급1개공제구;(2)산자고속물충수도료순화선택적작용,차재진화과정중적루료경다적비동의체환;(3)산자고속위우치과조류계통수적기부위치,기중백미산자고여홍후산자고호위저매군,해남산자고위우산자고속적기부위치,여기타3충산자고조류적친연관계교원.
