安徽农业科学
安徽農業科學
안휘농업과학
JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
30期
10469-10471,10502
,共4页
徐西林%向妍%张永生%周玮
徐西林%嚮妍%張永生%週瑋
서서림%향연%장영생%주위
EV71病毒%全基因组%E距离%Kimura 2-parameter距离%亲缘关系
EV71病毒%全基因組%E距離%Kimura 2-parameter距離%親緣關繫
EV71병독%전기인조%E거리%Kimura 2-parameter거리%친연관계
Enterovirus71 (EV71)%Genome%E distance%Kimura 2-parameter distance%Phylogenetic tree
[目的]了解世界各地EV71病毒的亲缘关系.[方法]下栽了NCBI数据库所有EV71全基因组序列,以常用的Kimura 2-parameter距离和E距离进行距离矩阵邻接法建树.[结果]基于E距离和Kimura 2-parameter距离构建的进化树结果一致,2种方法均支持EV71进化树反映出的基于全基因组的病毒亲缘关系.[结论]E距离是病毒系统发育应用中另一种颇具潜力的新距离,能为鉴定EV71病毒亲缘关系提供支持.
[目的]瞭解世界各地EV71病毒的親緣關繫.[方法]下栽瞭NCBI數據庫所有EV71全基因組序列,以常用的Kimura 2-parameter距離和E距離進行距離矩陣鄰接法建樹.[結果]基于E距離和Kimura 2-parameter距離構建的進化樹結果一緻,2種方法均支持EV71進化樹反映齣的基于全基因組的病毒親緣關繫.[結論]E距離是病毒繫統髮育應用中另一種頗具潛力的新距離,能為鑒定EV71病毒親緣關繫提供支持.
[목적]료해세계각지EV71병독적친연관계.[방법]하재료NCBI수거고소유EV71전기인조서렬,이상용적Kimura 2-parameter거리화E거리진행거리구진린접법건수.[결과]기우E거리화Kimura 2-parameter거리구건적진화수결과일치,2충방법균지지EV71진화수반영출적기우전기인조적병독친연관계.[결론]E거리시병독계통발육응용중령일충파구잠력적신거리,능위감정EV71병독친연관계제공지지.