河南农业科学
河南農業科學
하남농업과학
JOURNAL OF HENAN AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
10期
117-122
,共6页
鸡%卵泡%数字基因表达谱%差异表达基因%基质金属蛋白酶
鷄%卵泡%數字基因錶達譜%差異錶達基因%基質金屬蛋白酶
계%란포%수자기인표체보%차이표체기인%기질금속단백매
chicken%follicle%digital gene expression profiling%differential expression genes%MMP
为筛选禽类卵泡募集、等级化维持及排卵过程中的关键基因，通过数字基因表达谱检测鸡卵巢内等级前小白卵泡（SWF）和发育到最大期的等级卵泡（F1）中的差异表达基因。结果显示，随着卵泡的成熟，显著上调表达的基因有784个，显著下调的基因有1526个。基因表达差异倍数达到5倍以上的上调基因包括 PTGS1、TEK、VEGF A 、MMP 3、CDK1等；下调基因包括β cate-nin 、ZO 1、Nectin 3、PTPX15、Gadd45等。对差异表达基因进行基因本体（GO）生物学分析和信号通路显著富集分析发现，差异表达的基因所编码的蛋白主要参与生物学催化反应、分子连接、转移酶活性、水解等生物学过程；主要与细胞黏合通路、p53信号通路、蛋白合成通路及细胞周期通路等信号通路有关。对卵泡发育过程中的基质金属蛋白酶家族（MMPs）的 MMP 3与 MMP 9基因表达变化进行测定发现，MMP 3基因表达量在卵泡发育过程中显著升高，排卵后的卵泡中显著下降；MMP 9基因表达量则持续显著升高，在排卵后第2天的卵泡中下降，但下降不明显。
為篩選禽類卵泡募集、等級化維持及排卵過程中的關鍵基因，通過數字基因錶達譜檢測鷄卵巢內等級前小白卵泡（SWF）和髮育到最大期的等級卵泡（F1）中的差異錶達基因。結果顯示，隨著卵泡的成熟，顯著上調錶達的基因有784箇，顯著下調的基因有1526箇。基因錶達差異倍數達到5倍以上的上調基因包括 PTGS1、TEK、VEGF A 、MMP 3、CDK1等；下調基因包括β cate-nin 、ZO 1、Nectin 3、PTPX15、Gadd45等。對差異錶達基因進行基因本體（GO）生物學分析和信號通路顯著富集分析髮現，差異錶達的基因所編碼的蛋白主要參與生物學催化反應、分子連接、轉移酶活性、水解等生物學過程；主要與細胞黏閤通路、p53信號通路、蛋白閤成通路及細胞週期通路等信號通路有關。對卵泡髮育過程中的基質金屬蛋白酶傢族（MMPs）的 MMP 3與 MMP 9基因錶達變化進行測定髮現，MMP 3基因錶達量在卵泡髮育過程中顯著升高，排卵後的卵泡中顯著下降；MMP 9基因錶達量則持續顯著升高，在排卵後第2天的卵泡中下降，但下降不明顯。
위사선금류란포모집、등급화유지급배란과정중적관건기인，통과수자기인표체보검측계란소내등급전소백란포（SWF）화발육도최대기적등급란포（F1）중적차이표체기인。결과현시，수착란포적성숙，현저상조표체적기인유784개，현저하조적기인유1526개。기인표체차이배수체도5배이상적상조기인포괄 PTGS1、TEK、VEGF A 、MMP 3、CDK1등；하조기인포괄β cate-nin 、ZO 1、Nectin 3、PTPX15、Gadd45등。대차이표체기인진행기인본체（GO）생물학분석화신호통로현저부집분석발현，차이표체적기인소편마적단백주요삼여생물학최화반응、분자련접、전이매활성、수해등생물학과정；주요여세포점합통로、p53신호통로、단백합성통로급세포주기통로등신호통로유관。대란포발육과정중적기질금속단백매가족（MMPs）적 MMP 3여 MMP 9기인표체변화진행측정발현，MMP 3기인표체량재란포발육과정중현저승고，배란후적란포중현저하강；MMP 9기인표체량칙지속현저승고，재배란후제2천적란포중하강，단하강불명현。
To identify the key genes involved in follicular recruitment,hierarchies and ovulation, the differently expressed genes profile in pre-hierarchical follicles(small white follicles,SWF)and the pre-ovulatory follicles(the first largest follicle,F1)were obtained by using Solexa/Illusion RNA-seqencing.In this study,784 up-regulated and 1 526 down-regulated genes in F1 follicles were identified compared to SWF follicles.The genes up-regulated more than five folds included PTGS1 ,TEK,VEGF-A ,MMP-3 and CDK1 .As the same down-regulated genes included β-catenin,ZO-1 ,Nectin-3 ,PTPX15 and Gadd45 .GO analysis indicated that the protein encoded by the differently expressed genes mainly involved in biological processes including activation of different transferases,molecular connectivity enzymatic hydrolysis and proteolysis.The pathway analysis suggested that the differently expressed genes mainly took part in cell adherence junction,p53 pathway,protein synthesis,and cell cycle pathways during follicle development. Furthermore,the expression patterns of MMP-3 and MMP-9 genes in chicken hierarchy follicles showed that the two genes expression levels increased during follicular maturation,MMP-3 expression level reached maximum in the first largest follicle(F1),while MMP-9 expression level continued to rise in POF1 and POF2 after ovulation.
