农业生物技术学报
農業生物技術學報
농업생물기술학보
JOURNAL OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY
2014年
10期
1306-1313
,共8页
玉米%Fosmid文库%转座子
玉米%Fosmid文庫%轉座子
옥미%Fosmid문고%전좌자
Zea mays L.%Fosmid library%Transposon
玉米(Zea mays L.)病害的发生和流行是限制玉米高产稳产的重要因素.玉米细菌性褐斑病是目前具有潜在危害性的病害之一,在抗性基因遗传规律和染色体定位研究方面取得一定进展,但在基因克隆、功能鉴定等研究上进展较为缓慢,利用构建的Fosmid文库克隆抗病候选基因是目前较为快捷和有效的方法之一.本研究以玉米细菌性褐斑病的抗病自交系F349为材料构建了玉米Fosmid文库,克隆总数约为3.7×105个,平均插入片段长度为32 kb,实现4.73倍的玉米基因组覆盖,筛选到任意基因或序列的概率达到了99.12%.基于该文库,利用不同引物组合进行了两个类受体蛋白激酶基因(Psy1和Psy2)的克隆筛选,得到14个阳性克隆,其中4个阳性克隆包含Psy2基因和Psy1基因部分片段;3个阳性克隆包含完整Psy1基因;对其中两个阳性克隆13-12F-23和32-4A-6的测序结果显示,Psy1基因的启动子和内含子分别被插入了10.0和13.5 kb的外源片段;13.5 kb的插入片段是LTR家族的huck反转录转座子,10.0kb的插入片段是含有helitron转座元件的复杂转座子;扩增到了Psy1基因的cDNA全长,说明这两种类型反转录转座子的插入并未使基因失活.本研究为玉米基因的克隆和功能分析提供了一种可行的研究途径.
玉米(Zea mays L.)病害的髮生和流行是限製玉米高產穩產的重要因素.玉米細菌性褐斑病是目前具有潛在危害性的病害之一,在抗性基因遺傳規律和染色體定位研究方麵取得一定進展,但在基因剋隆、功能鑒定等研究上進展較為緩慢,利用構建的Fosmid文庫剋隆抗病候選基因是目前較為快捷和有效的方法之一.本研究以玉米細菌性褐斑病的抗病自交繫F349為材料構建瞭玉米Fosmid文庫,剋隆總數約為3.7×105箇,平均插入片段長度為32 kb,實現4.73倍的玉米基因組覆蓋,篩選到任意基因或序列的概率達到瞭99.12%.基于該文庫,利用不同引物組閤進行瞭兩箇類受體蛋白激酶基因(Psy1和Psy2)的剋隆篩選,得到14箇暘性剋隆,其中4箇暘性剋隆包含Psy2基因和Psy1基因部分片段;3箇暘性剋隆包含完整Psy1基因;對其中兩箇暘性剋隆13-12F-23和32-4A-6的測序結果顯示,Psy1基因的啟動子和內含子分彆被插入瞭10.0和13.5 kb的外源片段;13.5 kb的插入片段是LTR傢族的huck反轉錄轉座子,10.0kb的插入片段是含有helitron轉座元件的複雜轉座子;擴增到瞭Psy1基因的cDNA全長,說明這兩種類型反轉錄轉座子的插入併未使基因失活.本研究為玉米基因的剋隆和功能分析提供瞭一種可行的研究途徑.
옥미(Zea mays L.)병해적발생화류행시한제옥미고산은산적중요인소.옥미세균성갈반병시목전구유잠재위해성적병해지일,재항성기인유전규률화염색체정위연구방면취득일정진전,단재기인극륭、공능감정등연구상진전교위완만,이용구건적Fosmid문고극륭항병후선기인시목전교위쾌첩화유효적방법지일.본연구이옥미세균성갈반병적항병자교계F349위재료구건료옥미Fosmid문고,극륭총수약위3.7×105개,평균삽입편단장도위32 kb,실현4.73배적옥미기인조복개,사선도임의기인혹서렬적개솔체도료99.12%.기우해문고,이용불동인물조합진행료량개류수체단백격매기인(Psy1화Psy2)적극륭사선,득도14개양성극륭,기중4개양성극륭포함Psy2기인화Psy1기인부분편단;3개양성극륭포함완정Psy1기인;대기중량개양성극륭13-12F-23화32-4A-6적측서결과현시,Psy1기인적계동자화내함자분별피삽입료10.0화13.5 kb적외원편단;13.5 kb적삽입편단시LTR가족적huck반전록전좌자,10.0kb적삽입편단시함유helitron전좌원건적복잡전좌자;확증도료Psy1기인적cDNA전장,설명저량충류형반전록전좌자적삽입병미사기인실활.본연구위옥미기인적극륭화공능분석제공료일충가행적연구도경.