农业生物技术学报
農業生物技術學報
농업생물기술학보
JOURNAL OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY
2014年
10期
1269-1276
,共8页
樊庆灿%王金玉%张跟喜%张涛%王文浩%顾玉萍%王永娟
樊慶燦%王金玉%張跟喜%張濤%王文浩%顧玉萍%王永娟
번경찬%왕금옥%장근희%장도%왕문호%고옥평%왕영연
京海黄鸡%繁殖性状%全基因组关联分析(GWAS)%单核苷酸多态(SNP)
京海黃鷄%繁殖性狀%全基因組關聯分析(GWAS)%單覈苷痠多態(SNP)
경해황계%번식성상%전기인조관련분석(GWAS)%단핵감산다태(SNP)
Jinghai yellow Chicken%Reproduction traits%Genome-wide association analysis(GWAS)%Single nucleotide polymorphism(SNP)
为了寻找影响鸡(Gallus gallus)繁殖性状的候选基因,本研究利用单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)芯片分型技术,利用已报道的影响鸡繁殖性状的29个位点对396只京海黄鸡母鸡的29个位点直接进行SNP分型,并对11个繁殖性状进行关联分析.结果发现,29个SNP中,有12个SNP与至少1个繁殖性状关联显著(P<0.05),其中有7个SNP同时与2个繁殖性状关联显著(P<0.05).所有繁殖性状中,与京海黄鸡开产体重关联显著的SNP有1个,与京海黄鸡462 d产蛋数关联显著的SNP有2个,与蛋重关联显著的SNP有6个,与开产体重关联显著的SNP有6个,与综合选择指数关联显著的SNP有2个,与后代健雏率关联显著的SNP有1个,没有发现与300 d产蛋数、300~462 d产蛋数和后代孵化率关联显著的SNP.同时,根据这些位点的群体遗传参数发现,12个SNP的平均多态信息含量偏低,说明京海黄鸡有持续选育提高的可能性和必要性.大部分有利基因型为纯合基因型,但有部分基因型为杂合基因型.对与12个SNP最近的功能基因犰狳(Priodontes maximus)重复基因(armadillo repeat gene deleted in velocardiofacial syndrome,ARVCF)、集落刺激因子3受体基因(colony stimulating factor 3 receptor,CSF3R)和ODZ同源物2基因(odz,odd Oz/ten-m homolog 2,ODZ2)的功能探讨发现,这些基因可以通过不同的途径影响鸡的繁殖性状.本研究为鸡繁殖性状候选基因的进一步研究提供了基础资料.
為瞭尋找影響鷄(Gallus gallus)繁殖性狀的候選基因,本研究利用單覈苷痠多態(single nucleotide polymorphism,SNP)芯片分型技術,利用已報道的影響鷄繁殖性狀的29箇位點對396隻京海黃鷄母鷄的29箇位點直接進行SNP分型,併對11箇繁殖性狀進行關聯分析.結果髮現,29箇SNP中,有12箇SNP與至少1箇繁殖性狀關聯顯著(P<0.05),其中有7箇SNP同時與2箇繁殖性狀關聯顯著(P<0.05).所有繁殖性狀中,與京海黃鷄開產體重關聯顯著的SNP有1箇,與京海黃鷄462 d產蛋數關聯顯著的SNP有2箇,與蛋重關聯顯著的SNP有6箇,與開產體重關聯顯著的SNP有6箇,與綜閤選擇指數關聯顯著的SNP有2箇,與後代健雛率關聯顯著的SNP有1箇,沒有髮現與300 d產蛋數、300~462 d產蛋數和後代孵化率關聯顯著的SNP.同時,根據這些位點的群體遺傳參數髮現,12箇SNP的平均多態信息含量偏低,說明京海黃鷄有持續選育提高的可能性和必要性.大部分有利基因型為純閤基因型,但有部分基因型為雜閤基因型.對與12箇SNP最近的功能基因犰狳(Priodontes maximus)重複基因(armadillo repeat gene deleted in velocardiofacial syndrome,ARVCF)、集落刺激因子3受體基因(colony stimulating factor 3 receptor,CSF3R)和ODZ同源物2基因(odz,odd Oz/ten-m homolog 2,ODZ2)的功能探討髮現,這些基因可以通過不同的途徑影響鷄的繁殖性狀.本研究為鷄繁殖性狀候選基因的進一步研究提供瞭基礎資料.
위료심조영향계(Gallus gallus)번식성상적후선기인,본연구이용단핵감산다태(single nucleotide polymorphism,SNP)심편분형기술,이용이보도적영향계번식성상적29개위점대396지경해황계모계적29개위점직접진행SNP분형,병대11개번식성상진행관련분석.결과발현,29개SNP중,유12개SNP여지소1개번식성상관련현저(P<0.05),기중유7개SNP동시여2개번식성상관련현저(P<0.05).소유번식성상중,여경해황계개산체중관련현저적SNP유1개,여경해황계462 d산단수관련현저적SNP유2개,여단중관련현저적SNP유6개,여개산체중관련현저적SNP유6개,여종합선택지수관련현저적SNP유2개,여후대건추솔관련현저적SNP유1개,몰유발현여300 d산단수、300~462 d산단수화후대부화솔관련현저적SNP.동시,근거저사위점적군체유전삼수발현,12개SNP적평균다태신식함량편저,설명경해황계유지속선육제고적가능성화필요성.대부분유리기인형위순합기인형,단유부분기인형위잡합기인형.대여12개SNP최근적공능기인구여(Priodontes maximus)중복기인(armadillo repeat gene deleted in velocardiofacial syndrome,ARVCF)、집락자격인자3수체기인(colony stimulating factor 3 receptor,CSF3R)화ODZ동원물2기인(odz,odd Oz/ten-m homolog 2,ODZ2)적공능탐토발현,저사기인가이통과불동적도경영향계적번식성상.본연구위계번식성상후선기인적진일보연구제공료기출자료.