长江大学学报(自科版)石油/农学中旬刊
長江大學學報(自科版)石油/農學中旬刊
장강대학학보(자과판)석유/농학중순간
Journal of Yangtze University (Natural Science Edition)
2014年
10期
49-55
,共7页
孟冉%杨代勤%阮国良
孟冉%楊代勤%阮國良
맹염%양대근%원국량
黄鳝 (Monopterus albus)%α-淀粉酶%克隆%序列分析
黃鱔 (Monopterus albus)%α-澱粉酶%剋隆%序列分析
황선 (Monopterus albus)%α-정분매%극륭%서렬분석
采用 RT-PCR 及 RACE 技术克隆了黄鳝(Monopterus albus)α-淀粉酶 cDNA 全长序列。结果表明,黄鳝α-淀粉酶 cDNA 全长1607bp ,其中5’非编码区(5’ UTR)为2bp ,3’非编码区(3’ UTR)为54bp ,开放阅读框(ORF)1551bp ,编码516个氨基酸。推导氨基酸序列分析表明,黄鳝α-淀粉酶包含与哺乳动物α-淀粉酶相似的8个α螺旋和7个β折叠,以及10个保守的半胱氨酸(Cys)残基。蛋白质序列相似性分析显示,黄鳝α-淀粉酶与斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)α-淀粉酶相似性为84.2%,与其他已研究鱼类和人类α-淀粉酶的相似性在69.9%~78.7%之间。进化树分析显示,黄鳝α-淀粉酶与其他鱼类α-淀粉酶聚为一支。
採用 RT-PCR 及 RACE 技術剋隆瞭黃鱔(Monopterus albus)α-澱粉酶 cDNA 全長序列。結果錶明,黃鱔α-澱粉酶 cDNA 全長1607bp ,其中5’非編碼區(5’ UTR)為2bp ,3’非編碼區(3’ UTR)為54bp ,開放閱讀框(ORF)1551bp ,編碼516箇氨基痠。推導氨基痠序列分析錶明,黃鱔α-澱粉酶包含與哺乳動物α-澱粉酶相似的8箇α螺鏇和7箇β摺疊,以及10箇保守的半胱氨痠(Cys)殘基。蛋白質序列相似性分析顯示,黃鱔α-澱粉酶與斜帶石斑魚(Epinephelus coioides)α-澱粉酶相似性為84.2%,與其他已研究魚類和人類α-澱粉酶的相似性在69.9%~78.7%之間。進化樹分析顯示,黃鱔α-澱粉酶與其他魚類α-澱粉酶聚為一支。
채용 RT-PCR 급 RACE 기술극륭료황선(Monopterus albus)α-정분매 cDNA 전장서렬。결과표명,황선α-정분매 cDNA 전장1607bp ,기중5’비편마구(5’ UTR)위2bp ,3’비편마구(3’ UTR)위54bp ,개방열독광(ORF)1551bp ,편마516개안기산。추도안기산서렬분석표명,황선α-정분매포함여포유동물α-정분매상사적8개α라선화7개β절첩,이급10개보수적반광안산(Cys)잔기。단백질서렬상사성분석현시,황선α-정분매여사대석반어(Epinephelus coioides)α-정분매상사성위84.2%,여기타이연구어류화인류α-정분매적상사성재69.9%~78.7%지간。진화수분석현시,황선α-정분매여기타어류α-정분매취위일지。