上海交通大学学报（农业科学版）
上海交通大學學報（農業科學版）
상해교통대학학보（농업과학판）
JOURNAL OF SHANGHAI JIAOTONG UNIVERSITY(AGRICULTURAL SCIENCE)
2014年
5期
33-38
,共6页
LASSO%迭代加权最小二乘法%多QTL定位%模拟
LASSO%迭代加權最小二乘法%多QTL定位%模擬
LASSO%질대가권최소이승법%다QTL정위%모의
LASSO%IRLS%multiple QTL mapping%simulation
此篇文章中,应用一种基于LASSO的算法去同时定位多个数量性状位点(QTL).在QTL定位方法中,迭代加权最小二乘法(IRLS)和极大似然法(ML)在参数估计准确性和检测效率方面效果几乎一致.但是在参数估计的稳健性和计算速度方面,迭代加权最小二乘法又明显优于极大似然估计.结合参数的先验分布信息,基于贝叶斯理论的极大似然估计能够分析多QTL模型.然而迭代加权最小二乘估计不能很好的检测多QTL.目前贝叶斯分析已经成为一个多QTL定位的重要的途径,但它主要缺点是计算时间过长,并缺乏简单有效的显著性检验.通过循环坐标下降的LASSO方法可将全模型的系数同时压缩并使之趋进于零,因此该方法能应用于快速同时估计整个基因组的非零遗传效应位点.在这个研究中,应用基于LASSO的算法去同时定位多QTL.模拟证明LASSO方法比迭代加权最小二乘法具有更高的估计精度和检测效率.
此篇文章中,應用一種基于LASSO的算法去同時定位多箇數量性狀位點(QTL).在QTL定位方法中,迭代加權最小二乘法(IRLS)和極大似然法(ML)在參數估計準確性和檢測效率方麵效果幾乎一緻.但是在參數估計的穩健性和計算速度方麵,迭代加權最小二乘法又明顯優于極大似然估計.結閤參數的先驗分佈信息,基于貝葉斯理論的極大似然估計能夠分析多QTL模型.然而迭代加權最小二乘估計不能很好的檢測多QTL.目前貝葉斯分析已經成為一箇多QTL定位的重要的途徑,但它主要缺點是計算時間過長,併缺乏簡單有效的顯著性檢驗.通過循環坐標下降的LASSO方法可將全模型的繫數同時壓縮併使之趨進于零,因此該方法能應用于快速同時估計整箇基因組的非零遺傳效應位點.在這箇研究中,應用基于LASSO的算法去同時定位多QTL.模擬證明LASSO方法比迭代加權最小二乘法具有更高的估計精度和檢測效率.
차편문장중,응용일충기우LASSO적산법거동시정위다개수량성상위점(QTL).재QTL정위방법중,질대가권최소이승법(IRLS)화겁대사연법(ML)재삼수고계준학성화검측효솔방면효과궤호일치.단시재삼수고계적은건성화계산속도방면,질대가권최소이승법우명현우우겁대사연고계.결합삼수적선험분포신식,기우패협사이론적겁대사연고계능구분석다QTL모형.연이질대가권최소이승고계불능흔호적검측다QTL.목전패협사분석이경성위일개다QTL정위적중요적도경,단타주요결점시계산시간과장,병결핍간단유효적현저성검험.통과순배좌표하강적LASSO방법가장전모형적계수동시압축병사지추진우령,인차해방법능응용우쾌속동시고계정개기인조적비령유전효응위점.재저개연구중,응용기우LASSO적산법거동시정위다QTL.모의증명LASSO방법비질대가권최소이승법구유경고적고계정도화검측효솔.
