广东农业科学
廣東農業科學
엄동농업과학
GUANGDONG AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
20期
131-135,140,封3
,共7页
毛白杨%阿魏酸-5-羟化酶%基因克隆%生物信息学
毛白楊%阿魏痠-5-羥化酶%基因剋隆%生物信息學
모백양%아위산-5-간화매%기인극륭%생물신식학
克隆毛白杨阿魏酸-5-羟基化酶(F5H)基因全长序列,并通过生物信息学分析,为进一步研究F5H基因功能提供基础.利用RT-PCR方法成功从毛白杨741组培苗叶片中克隆了F5H基因,并对F5H基因的核苷酸序列及推导的氨基酸序列进行分析,包括疏水性-亲水性、氨基酸翻译后修饰、亚细胞定位、跨膜结构域、蛋白质二级三级功能结构域等进行分析预测和推断.获得的基因长度为l 686 bp,编码区1542 bp,与已公布的毛果杨F5H mRNA序列(GenBank登录号为AJ010324)的编码区相似性达97.45％,并与其他植物的该基因序列具有同源性.F5H是亲水性较强的蛋白,整条肽链有1个跨膜结构域;通过亚细胞定位表明F5H主要位于质体中,并含有磷酸化位点有19个.F5H含有丰富的二级结构,卷曲占44.44％、折叠占7.02％、螺旋占48.54％,并预测了其三维结构.分析结果显示,植物的阿魏酸-5-羟基化酶是一个具有跨膜结构域的亲水性蛋白,在内质网等分泌途径中表达.
剋隆毛白楊阿魏痠-5-羥基化酶(F5H)基因全長序列,併通過生物信息學分析,為進一步研究F5H基因功能提供基礎.利用RT-PCR方法成功從毛白楊741組培苗葉片中剋隆瞭F5H基因,併對F5H基因的覈苷痠序列及推導的氨基痠序列進行分析,包括疏水性-親水性、氨基痠翻譯後脩飾、亞細胞定位、跨膜結構域、蛋白質二級三級功能結構域等進行分析預測和推斷.穫得的基因長度為l 686 bp,編碼區1542 bp,與已公佈的毛果楊F5H mRNA序列(GenBank登錄號為AJ010324)的編碼區相似性達97.45％,併與其他植物的該基因序列具有同源性.F5H是親水性較彊的蛋白,整條肽鏈有1箇跨膜結構域;通過亞細胞定位錶明F5H主要位于質體中,併含有燐痠化位點有19箇.F5H含有豐富的二級結構,捲麯佔44.44％、摺疊佔7.02％、螺鏇佔48.54％,併預測瞭其三維結構.分析結果顯示,植物的阿魏痠-5-羥基化酶是一箇具有跨膜結構域的親水性蛋白,在內質網等分泌途徑中錶達.
극륭모백양아위산-5-간기화매(F5H)기인전장서렬,병통과생물신식학분석,위진일보연구F5H기인공능제공기출.이용RT-PCR방법성공종모백양741조배묘협편중극륭료F5H기인,병대F5H기인적핵감산서렬급추도적안기산서렬진행분석,포괄소수성-친수성、안기산번역후수식、아세포정위、과막결구역、단백질이급삼급공능결구역등진행분석예측화추단.획득적기인장도위l 686 bp,편마구1542 bp,여이공포적모과양F5H mRNA서렬(GenBank등록호위AJ010324)적편마구상사성체97.45％,병여기타식물적해기인서렬구유동원성.F5H시친수성교강적단백,정조태련유1개과막결구역;통과아세포정위표명F5H주요위우질체중,병함유린산화위점유19개.F5H함유봉부적이급결구,권곡점44.44％、절첩점7.02％、라선점48.54％,병예측료기삼유결구.분석결과현시,식물적아위산-5-간기화매시일개구유과막결구역적친수성단백,재내질망등분비도경중표체.
