中国医药导报
中國醫藥導報
중국의약도보
CHINA MEDICAL HERALD
2014年
31期
4-9
,共6页
张蔚%刘珍%胡晓霞%郑文静%曾康康
張蔚%劉珍%鬍曉霞%鄭文靜%曾康康
장위%류진%호효하%정문정%증강강
miRNA-497%miRNA-195%miRNA-497-195基因簇%宫颈癌%miRNA芯片%靶基因%生物信息学
miRNA-497%miRNA-195%miRNA-497-195基因簇%宮頸癌%miRNA芯片%靶基因%生物信息學
miRNA-497%miRNA-195%miRNA-497-195기인족%궁경암%miRNA심편%파기인%생물신식학
miRNA-497%miRNA-195%miRNA-497-195 cluster%Cervical cancer%miRNA array%Target gene%Bioinformatic
目的 探讨miRNA-497-195基因簇在宫颈癌组织中的表达,并对其预测的靶基因进行生物信息学分析,为miRNA-497-195基因簇在宫颈癌发生中的作用机制研究提供理论基础.方法 收集2010年3月~2012年3月在广西壮族自治区人民医院就诊患者的宫颈标本,利用miRNA芯片技术检测宫颈病变组织中miRNA表达谱,用real-time RT-PCR进行验证;采用real-time RT-PCR检测miRNA-497和miRNA-195在宫颈病变组织中的表达情况,并用Spearman法进行miRNA-497与miRNA-195相关性分析.通过生物信息学预测miRNA-497和miRNA-195的靶基因,并对其靶基因进行GO (gene ontology)功能富集分析及信号转导通路富集分析.结果 芯片结果显示,宫颈癌及高度鳞状上皮内瘤变中miRNA-195和miRNA-497表现为下调(均P<0.05).real-timeRT-PCR结果显示,miRNA-497和miRNA-195在宫颈癌组织中表现为下调,且表达存在显著性相关(r=0.983,P<0.05).miRNA-497和miRNA-195预测靶基因大量重合,且集合功能也大量重合,并富集于细胞周期调控、生物学过程调控、转录调控、基因表达及核苷酸代谢过程等生物学过程,以及蛋白结合、核酸结合、蛋白激酶活性、连接酶活性等分子功能(P< 0.01);KEGG通路分析涉及癌症通路、p53信号通路、GnRH信号通路、细胞外因子信号通路等信号传导通路及直肠癌、前列腺癌、甲状腺癌、黑色素瘤、慢性粒细胞性白血病、非小细胞肺癌等疾病通路(P<0.05).结论 miRNA-195和miRNA-497在宫颈癌组织中呈现低表达,二者表达呈显著正相关,miRNA-497-195基因簇可能是宫颈癌的抑制因子.miRNA-497和miRNA-195预测靶基因功能大量重合,并显著富集在与肿瘤发生相关的信号通路中.
目的 探討miRNA-497-195基因簇在宮頸癌組織中的錶達,併對其預測的靶基因進行生物信息學分析,為miRNA-497-195基因簇在宮頸癌髮生中的作用機製研究提供理論基礎.方法 收集2010年3月~2012年3月在廣西壯族自治區人民醫院就診患者的宮頸標本,利用miRNA芯片技術檢測宮頸病變組織中miRNA錶達譜,用real-time RT-PCR進行驗證;採用real-time RT-PCR檢測miRNA-497和miRNA-195在宮頸病變組織中的錶達情況,併用Spearman法進行miRNA-497與miRNA-195相關性分析.通過生物信息學預測miRNA-497和miRNA-195的靶基因,併對其靶基因進行GO (gene ontology)功能富集分析及信號轉導通路富集分析.結果 芯片結果顯示,宮頸癌及高度鱗狀上皮內瘤變中miRNA-195和miRNA-497錶現為下調(均P<0.05).real-timeRT-PCR結果顯示,miRNA-497和miRNA-195在宮頸癌組織中錶現為下調,且錶達存在顯著性相關(r=0.983,P<0.05).miRNA-497和miRNA-195預測靶基因大量重閤,且集閤功能也大量重閤,併富集于細胞週期調控、生物學過程調控、轉錄調控、基因錶達及覈苷痠代謝過程等生物學過程,以及蛋白結閤、覈痠結閤、蛋白激酶活性、連接酶活性等分子功能(P< 0.01);KEGG通路分析涉及癌癥通路、p53信號通路、GnRH信號通路、細胞外因子信號通路等信號傳導通路及直腸癌、前列腺癌、甲狀腺癌、黑色素瘤、慢性粒細胞性白血病、非小細胞肺癌等疾病通路(P<0.05).結論 miRNA-195和miRNA-497在宮頸癌組織中呈現低錶達,二者錶達呈顯著正相關,miRNA-497-195基因簇可能是宮頸癌的抑製因子.miRNA-497和miRNA-195預測靶基因功能大量重閤,併顯著富集在與腫瘤髮生相關的信號通路中.
목적 탐토miRNA-497-195기인족재궁경암조직중적표체,병대기예측적파기인진행생물신식학분석,위miRNA-497-195기인족재궁경암발생중적작용궤제연구제공이론기출.방법 수집2010년3월~2012년3월재엄서장족자치구인민의원취진환자적궁경표본,이용miRNA심편기술검측궁경병변조직중miRNA표체보,용real-time RT-PCR진행험증;채용real-time RT-PCR검측miRNA-497화miRNA-195재궁경병변조직중적표체정황,병용Spearman법진행miRNA-497여miRNA-195상관성분석.통과생물신식학예측miRNA-497화miRNA-195적파기인,병대기파기인진행GO (gene ontology)공능부집분석급신호전도통로부집분석.결과 심편결과현시,궁경암급고도린상상피내류변중miRNA-195화miRNA-497표현위하조(균P<0.05).real-timeRT-PCR결과현시,miRNA-497화miRNA-195재궁경암조직중표현위하조,차표체존재현저성상관(r=0.983,P<0.05).miRNA-497화miRNA-195예측파기인대량중합,차집합공능야대량중합,병부집우세포주기조공、생물학과정조공、전록조공、기인표체급핵감산대사과정등생물학과정,이급단백결합、핵산결합、단백격매활성、련접매활성등분자공능(P< 0.01);KEGG통로분석섭급암증통로、p53신호통로、GnRH신호통로、세포외인자신호통로등신호전도통로급직장암、전렬선암、갑상선암、흑색소류、만성립세포성백혈병、비소세포폐암등질병통로(P<0.05).결론 miRNA-195화miRNA-497재궁경암조직중정현저표체,이자표체정현저정상관,miRNA-497-195기인족가능시궁경암적억제인자.miRNA-497화miRNA-195예측파기인공능대량중합,병현저부집재여종류발생상관적신호통로중.