食品与生物技术学报
食品與生物技術學報
식품여생물기술학보
JOURNAL OF FOOD SCIENCE AND BIOTECHNOLOGY
2014年
10期
1090-1095
,共6页
江南%张维利%李捷宇%刘奇龙%刘敏
江南%張維利%李捷宇%劉奇龍%劉敏
강남%장유리%리첩우%류기룡%류민
油茶%甘油二酯激酶基因%克隆%生物信息学分析%基因表达
油茶%甘油二酯激酶基因%剋隆%生物信息學分析%基因錶達
유다%감유이지격매기인%극륭%생물신식학분석%기인표체
Camellia oleifera%diacylglycerol kinase%cloning%bioinformatics analysis%gene expression
以油茶转录组数据为基础,采用RT-PCR和RACE技术,根据Unigene序列设计油茶甘油二酯激酶基因(CoDGK)RACE引物,分离克隆了DGK基因全长cDNA序列,命名为CoDGK3(GeneBank登录号:KM068056),基因全长1 568 bp,开放阅读框1 455 bp,编码485个氨基酸;氨基酸同源比对及序列分析表明油茶与其它物种的DGK氨基酸序列具有较高的相似性,其中与麻风树和毛果杨相似性最高,达到78％;利用生物学软件对蛋白质进行生物信息学分析,获得其结构特点及理化性质;分析转录组数据中DGK相关的Unigene序列RTKM值和对CoDGK3基因实施实时荧光定量PCR,结果表明CoDGK3在油荼种子发育各时期表达量变化差异不大,并且发现转录组数据分析和实时荧光定量分析的结果变化规律一致,证明了转录组测序的有效性.
以油茶轉錄組數據為基礎,採用RT-PCR和RACE技術,根據Unigene序列設計油茶甘油二酯激酶基因(CoDGK)RACE引物,分離剋隆瞭DGK基因全長cDNA序列,命名為CoDGK3(GeneBank登錄號:KM068056),基因全長1 568 bp,開放閱讀框1 455 bp,編碼485箇氨基痠;氨基痠同源比對及序列分析錶明油茶與其它物種的DGK氨基痠序列具有較高的相似性,其中與痳風樹和毛果楊相似性最高,達到78％;利用生物學軟件對蛋白質進行生物信息學分析,穫得其結構特點及理化性質;分析轉錄組數據中DGK相關的Unigene序列RTKM值和對CoDGK3基因實施實時熒光定量PCR,結果錶明CoDGK3在油荼種子髮育各時期錶達量變化差異不大,併且髮現轉錄組數據分析和實時熒光定量分析的結果變化規律一緻,證明瞭轉錄組測序的有效性.
이유다전록조수거위기출,채용RT-PCR화RACE기술,근거Unigene서렬설계유다감유이지격매기인(CoDGK)RACE인물,분리극륭료DGK기인전장cDNA서렬,명명위CoDGK3(GeneBank등록호:KM068056),기인전장1 568 bp,개방열독광1 455 bp,편마485개안기산;안기산동원비대급서렬분석표명유다여기타물충적DGK안기산서렬구유교고적상사성,기중여마풍수화모과양상사성최고,체도78％;이용생물학연건대단백질진행생물신식학분석,획득기결구특점급이화성질;분석전록조수거중DGK상관적Unigene서렬RTKM치화대CoDGK3기인실시실시형광정량PCR,결과표명CoDGK3재유도충자발육각시기표체량변화차이불대,병차발현전록조수거분석화실시형광정량분석적결과변화규률일치,증명료전록조측서적유효성.
