华中科技大学学报（医学版）
華中科技大學學報（醫學版）
화중과기대학학보（의학판）
ACTA UNIVERSITATIS MEDICINAE TONGJI
2014年
5期
506-511
,共6页
江莉莎%邬亭亭%刘平%郭述良
江莉莎%鄔亭亭%劉平%郭述良
강리사%오정정%류평%곽술량
分枝杆菌噬菌体Leo%基因组%结核分枝杆菌
分枝桿菌噬菌體Leo%基因組%結覈分枝桿菌
분지간균서균체Leo%기인조%결핵분지간균
mycobacteriophage Leo%genome%Mycobacterium tuberculosis
目的 筛选能有效裂解结核分枝杆菌的噬菌体,并了解其生物学和遗传学信息.方法 双层平板法扩增噬菌体,观察噬菌斑形态;电镜观察噬菌体颗粒形态;单斑法检测噬菌体宿主谱.采用λ噬菌体提取试剂盒提取噬菌体DNA,鸟枪法测序,得到的DNA序列用Phred/PhraD/Consedh软件包组装,拼接重叠群,PCR扩增重叠群缺口.采用DNAStar软件包、Glimmer3.0基因预测软件、Promoter prediction/Prokaryotic程序进行基因成分分析,基因功能预测,启动子区预测,并同时对Leo作共线性分析及构建系统进化树.结果 噬菌体Leo由多面体头部和尾部构成,头部直径(70.0±3.0)nm,尾长(211.0±31.7)nm.其噬菌斑清晰透明,能裂解不同的结核分枝杆菌临床分离株.Leo基因组全长39 981 bp,GC含量66.86％,含3个可能的启动子区,不含串联重复序列和tRNA区.Leo含59个基因,gene32编码整合酶,不含编码阻遏蛋白的基因和不利基因,Leo与BPs和Angel相似性最高.结论 噬菌体Leo是一株不含不利基因的裂解性噬菌体,能裂解结核分枝杆菌,可以作为鸡尾酒疗法的候选噬菌体.
目的 篩選能有效裂解結覈分枝桿菌的噬菌體,併瞭解其生物學和遺傳學信息.方法 雙層平闆法擴增噬菌體,觀察噬菌斑形態;電鏡觀察噬菌體顆粒形態;單斑法檢測噬菌體宿主譜.採用λ噬菌體提取試劑盒提取噬菌體DNA,鳥鎗法測序,得到的DNA序列用Phred/PhraD/Consedh軟件包組裝,拼接重疊群,PCR擴增重疊群缺口.採用DNAStar軟件包、Glimmer3.0基因預測軟件、Promoter prediction/Prokaryotic程序進行基因成分分析,基因功能預測,啟動子區預測,併同時對Leo作共線性分析及構建繫統進化樹.結果 噬菌體Leo由多麵體頭部和尾部構成,頭部直徑(70.0±3.0)nm,尾長(211.0±31.7)nm.其噬菌斑清晰透明,能裂解不同的結覈分枝桿菌臨床分離株.Leo基因組全長39 981 bp,GC含量66.86％,含3箇可能的啟動子區,不含串聯重複序列和tRNA區.Leo含59箇基因,gene32編碼整閤酶,不含編碼阻遏蛋白的基因和不利基因,Leo與BPs和Angel相似性最高.結論 噬菌體Leo是一株不含不利基因的裂解性噬菌體,能裂解結覈分枝桿菌,可以作為鷄尾酒療法的候選噬菌體.
목적 사선능유효렬해결핵분지간균적서균체,병료해기생물학화유전학신식.방법 쌍층평판법확증서균체,관찰서균반형태;전경관찰서균체과립형태;단반법검측서균체숙주보.채용λ서균체제취시제합제취서균체DNA,조창법측서,득도적DNA서렬용Phred/PhraD/Consedh연건포조장,병접중첩군,PCR확증중첩군결구.채용DNAStar연건포、Glimmer3.0기인예측연건、Promoter prediction/Prokaryotic정서진행기인성분분석,기인공능예측,계동자구예측,병동시대Leo작공선성분석급구건계통진화수.결과 서균체Leo유다면체두부화미부구성,두부직경(70.0±3.0)nm,미장(211.0±31.7)nm.기서균반청석투명,능렬해불동적결핵분지간균림상분리주.Leo기인조전장39 981 bp,GC함량66.86％,함3개가능적계동자구,불함천련중복서렬화tRNA구.Leo함59개기인,gene32편마정합매,불함편마조알단백적기인화불리기인,Leo여BPs화Angel상사성최고.결론 서균체Leo시일주불함불리기인적렬해성서균체,능렬해결핵분지간균,가이작위계미주요법적후선서균체.
