中华实验和临床病毒学杂志
中華實驗和臨床病毒學雜誌
중화실험화림상병독학잡지
CHINESE JOURNAL OF EXPERIMENTAL AND CLINICAL VIROLOGY
2013年
3期
164-166
,共3页
彭蕊%李丹地%蔡琨%覃家剑%王永霞%林强%郭延青%赵春燕%段招军
彭蕊%李丹地%蔡琨%覃傢劍%王永霞%林彊%郭延青%趙春燕%段招軍
팽예%리단지%채곤%담가검%왕영하%림강%곽연청%조춘연%단초군
轮状病毒属%流行病学%基因
輪狀病毒屬%流行病學%基因
륜상병독속%류행병학%기인
Rotavirus%Epidemiology%Genes
目的 了解GCRV在我国卢龙地区猪中流行状况和VP6蛋白编码基因的多样性特点,为猪GCRV的深入研究提供依据.方法 采集2007年冬至2008年春河北卢龙地区腹泻和正常猪粪便标本共793份.采用巢式反转录-聚合酶链反应(Nested RT-PCR)的方法对GCRV进行检测,并对测定序列进行同源性和系统进化分析.结果 在793份粪便标本中,GCRV阳性率为16.65%,卢龙地区猪GCRV毒株间同源性差异较大.核苷酸进化树表明,猪GCRV多样性显著.由氨基酸进化分析可知,同一宿主的GCRV氨基酸序列亲缘关系更近.结论 2007-2008年冬春两季,C组轮状病毒在我国卢龙地区猪中感染率较高.VP6基因多样性广泛存在.实验提供的数据为进一步研究猪GCRV的分子流行特征提供了基础.
目的 瞭解GCRV在我國盧龍地區豬中流行狀況和VP6蛋白編碼基因的多樣性特點,為豬GCRV的深入研究提供依據.方法 採集2007年鼕至2008年春河北盧龍地區腹瀉和正常豬糞便標本共793份.採用巢式反轉錄-聚閤酶鏈反應(Nested RT-PCR)的方法對GCRV進行檢測,併對測定序列進行同源性和繫統進化分析.結果 在793份糞便標本中,GCRV暘性率為16.65%,盧龍地區豬GCRV毒株間同源性差異較大.覈苷痠進化樹錶明,豬GCRV多樣性顯著.由氨基痠進化分析可知,同一宿主的GCRV氨基痠序列親緣關繫更近.結論 2007-2008年鼕春兩季,C組輪狀病毒在我國盧龍地區豬中感染率較高.VP6基因多樣性廣汎存在.實驗提供的數據為進一步研究豬GCRV的分子流行特徵提供瞭基礎.
목적 료해GCRV재아국로룡지구저중류행상황화VP6단백편마기인적다양성특점,위저GCRV적심입연구제공의거.방법 채집2007년동지2008년춘하북로룡지구복사화정상저분편표본공793빈.채용소식반전록-취합매련반응(Nested RT-PCR)적방법대GCRV진행검측,병대측정서렬진행동원성화계통진화분석.결과 재793빈분편표본중,GCRV양성솔위16.65%,로룡지구저GCRV독주간동원성차이교대.핵감산진화수표명,저GCRV다양성현저.유안기산진화분석가지,동일숙주적GCRV안기산서렬친연관계경근.결론 2007-2008년동춘량계,C조륜상병독재아국로룡지구저중감염솔교고.VP6기인다양성엄범존재.실험제공적수거위진일보연구저GCRV적분자류행특정제공료기출.
Objective To study the epdimiology characteristics and the diversity of VP6 gene of GCRV in Lulong,and to provide the basis for GCRV in-depth research.Methods 793 stool specimens from porcine with diarrhea or not from Lulong in 2007 and 2008.GCRV was detected by nested multiple reverse transcription-polymerase chain reaction (nested RT-PCR),and analyzed the identity and conducted phylogenetic tree by the seqences.Results The positive rate of GCRV was 16.65%.Porcine GCRV strains of Lulong had significant homology differences.Phylogenetic analysis indicated porcine GCRVs were with significant diversity.Amino acid analysis showed GCRV strains with the same host shared the nearest kinship.Conclusion The infection rate of GCRV was high from 2007 to 2008 in Lulong.Homology and phylogenetic analysis showed that VP6 gene diversity was widespread.The experimental data provided basis for molecular characteristics of porcine GCRVs.