中华实验和临床病毒学杂志
中華實驗和臨床病毒學雜誌
중화실험화림상병독학잡지
CHINESE JOURNAL OF EXPERIMENTAL AND CLINICAL VIROLOGY
2013年
3期
184-186
,共3页
陈克娜%田耕%靳森%李慧莹%李全瑞%康利红%张翠红%孔翔羽%高基民
陳剋娜%田耕%靳森%李慧瑩%李全瑞%康利紅%張翠紅%孔翔羽%高基民
진극나%전경%근삼%리혜형%리전서%강리홍%장취홍%공상우%고기민
诺如病毒%腹泻%胃肠炎%重组,遗传
諾如病毒%腹瀉%胃腸炎%重組,遺傳
낙여병독%복사%위장염%중조,유전
Norovirus%Diarrhea%Gastroenteritis%Recombination,genetic
目的 了解2008-2009年北京地区成人腹泻样本中诺如病毒(Norovirus,NoV)GⅡ.12型毒株的基因特征.方法 用三对引物对11株GⅡ.12型诺如病毒毒株RdRp,、ORF2、ORF3及ORF1/OFF2重叠区分别扩增,PCR产物纯化、克隆、测序,通过DNAStar、MEGA、SimPlot等生物软件进行比对、系统进化分析及重组分析.结果 根据系统进化分析,11株在RdRp区属于GⅡ.g,在ORF2和ORF3区均属于GⅡ.12.SimPlot分析进一步证实了11株均为GⅡ.g/GⅡ.12重组株.结论 北京地区流行的GⅡ.12型诺如病毒与世界其他地区流行的GⅡ.12型诺如病毒毒株均属同一毒株,确定了北京地区GⅡ.12型诺如病毒毒株的基因特征.
目的 瞭解2008-2009年北京地區成人腹瀉樣本中諾如病毒(Norovirus,NoV)GⅡ.12型毒株的基因特徵.方法 用三對引物對11株GⅡ.12型諾如病毒毒株RdRp,、ORF2、ORF3及ORF1/OFF2重疊區分彆擴增,PCR產物純化、剋隆、測序,通過DNAStar、MEGA、SimPlot等生物軟件進行比對、繫統進化分析及重組分析.結果 根據繫統進化分析,11株在RdRp區屬于GⅡ.g,在ORF2和ORF3區均屬于GⅡ.12.SimPlot分析進一步證實瞭11株均為GⅡ.g/GⅡ.12重組株.結論 北京地區流行的GⅡ.12型諾如病毒與世界其他地區流行的GⅡ.12型諾如病毒毒株均屬同一毒株,確定瞭北京地區GⅡ.12型諾如病毒毒株的基因特徵.
목적 료해2008-2009년북경지구성인복사양본중낙여병독(Norovirus,NoV)GⅡ.12형독주적기인특정.방법 용삼대인물대11주GⅡ.12형낙여병독독주RdRp,、ORF2、ORF3급ORF1/OFF2중첩구분별확증,PCR산물순화、극륭、측서,통과DNAStar、MEGA、SimPlot등생물연건진행비대、계통진화분석급중조분석.결과 근거계통진화분석,11주재RdRp구속우GⅡ.g,재ORF2화ORF3구균속우GⅡ.12.SimPlot분석진일보증실료11주균위GⅡ.g/GⅡ.12중조주.결론 북경지구류행적GⅡ.12형낙여병독여세계기타지구류행적GⅡ.12형낙여병독독주균속동일독주,학정료북경지구GⅡ.12형낙여병독독주적기인특정.
Objective To reveal the genetic characteristics of G Ⅱ.12 Norovirus strains isolating from stool samples of adults with diarrhea in Beijing during 2008-2009.Methods RdRp,ORF2,ORF3 and ORF1/ORF2 overlap region were respectively amplified by primers using RT-PCR.The products were purified,cloned,sequenced and then aligned,phylogenetie and recombinant analyzed by softwares of DNAStar,M EGA and SimPlot.Results According to the phylogenetic analysis,11 strains belonged to G Ⅱ.g in the RdRp region,while GⅡ.12 in the ORF2 and ORF3.SimPlot analysis further confirmed the 11 strains were recombinant strains (G Ⅱ.g [RdRp]/G Ⅱ.12 [capsid]).Conclusion G Ⅱ.12 Norovirus prevailing in Beijing and other regions of the world belonged to the same strain,and we identified the genetic characteristics of G Ⅱ.12 Norovirus in Beijing.