国际输血及血液学杂志
國際輸血及血液學雜誌
국제수혈급혈액학잡지
INTERNATIONAL JOURNAL OF BLOOD TRANSFUSION AND HEMATOLOGY
2014年
4期
333-336
,共4页
徐筠娉%王仙童%高素青%陶红
徐筠娉%王仙童%高素青%陶紅
서균빙%왕선동%고소청%도홍
主要组织相容复合体Ⅰ类相关基因A位点%新等位基因%分子克隆和单倍体测序
主要組織相容複閤體Ⅰ類相關基因A位點%新等位基因%分子剋隆和單倍體測序
주요조직상용복합체Ⅰ류상관기인A위점%신등위기인%분자극륭화단배체측서
Major histocompatibility complex class Ⅰ chain-related gene A%Novel allele%Cloning and haplotype sequencing
目的 鉴定中国深圳地区人群中新发现的1个主要组织相容复合物Ⅰ类相关基因A位点(MICA)等位基因,并对该新MICA基因的突变情况进行分析.方法 选择2012年1~12月,于深圳市血液中心行组织配型的供、患者中,1例MICA基因分型异常的健康供者作为研究对象.采用自主建立的基于聚合酶链反应-碱基序列直接测序(PCR-SBT)法对本例供者MICA基因第2~5外显子进行测序分型,利用分子克隆和单倍体测序的方法,鉴定出该个体MICA等位基因的序列.利用序列比对方法,对该MICA等位基因的突变情况进行分析.结果 于本例供者血液样品中,检出了1个新变异的MICA等位基因,其序列与MICA* 010∶01最为相近,但存在基因组DNA nt 637位点的碱基由胞嘧啶(C)突变为胸腺嘧啶(T),MICA基因第4外显子中的第1 91位密码子由CGC变异为TGC,导致氨基酸由精氨酸变异为半胱氨酸,该序列提交国际GenBank数据库(序列号:JN043370)和国际免疫遗传学信息系统/人类白细胞抗原(IMGT/HLA)数据库(序列号:HWS10013775),已被命名为MICA* 065.结论 新等位基因MICA* 065的变异碱基T,是1个全新的随机突变位点,未在MICA其他等位基因中发现.
目的 鑒定中國深圳地區人群中新髮現的1箇主要組織相容複閤物Ⅰ類相關基因A位點(MICA)等位基因,併對該新MICA基因的突變情況進行分析.方法 選擇2012年1~12月,于深圳市血液中心行組織配型的供、患者中,1例MICA基因分型異常的健康供者作為研究對象.採用自主建立的基于聚閤酶鏈反應-堿基序列直接測序(PCR-SBT)法對本例供者MICA基因第2~5外顯子進行測序分型,利用分子剋隆和單倍體測序的方法,鑒定齣該箇體MICA等位基因的序列.利用序列比對方法,對該MICA等位基因的突變情況進行分析.結果 于本例供者血液樣品中,檢齣瞭1箇新變異的MICA等位基因,其序列與MICA* 010∶01最為相近,但存在基因組DNA nt 637位點的堿基由胞嘧啶(C)突變為胸腺嘧啶(T),MICA基因第4外顯子中的第1 91位密碼子由CGC變異為TGC,導緻氨基痠由精氨痠變異為半胱氨痠,該序列提交國際GenBank數據庫(序列號:JN043370)和國際免疫遺傳學信息繫統/人類白細胞抗原(IMGT/HLA)數據庫(序列號:HWS10013775),已被命名為MICA* 065.結論 新等位基因MICA* 065的變異堿基T,是1箇全新的隨機突變位點,未在MICA其他等位基因中髮現.
목적 감정중국심수지구인군중신발현적1개주요조직상용복합물Ⅰ류상관기인A위점(MICA)등위기인,병대해신MICA기인적돌변정황진행분석.방법 선택2012년1~12월,우심수시혈액중심행조직배형적공、환자중,1례MICA기인분형이상적건강공자작위연구대상.채용자주건립적기우취합매련반응-감기서렬직접측서(PCR-SBT)법대본례공자MICA기인제2~5외현자진행측서분형,이용분자극륭화단배체측서적방법,감정출해개체MICA등위기인적서렬.이용서렬비대방법,대해MICA등위기인적돌변정황진행분석.결과 우본례공자혈액양품중,검출료1개신변이적MICA등위기인,기서렬여MICA* 010∶01최위상근,단존재기인조DNA nt 637위점적감기유포밀정(C)돌변위흉선밀정(T),MICA기인제4외현자중적제1 91위밀마자유CGC변이위TGC,도치안기산유정안산변이위반광안산,해서렬제교국제GenBank수거고(서렬호:JN043370)화국제면역유전학신식계통/인류백세포항원(IMGT/HLA)수거고(서렬호:HWS10013775),이피명명위MICA* 065.결론 신등위기인MICA* 065적변이감기T,시1개전신적수궤돌변위점,미재MICA기타등위기인중발현.
Objective To identify a novel MICA allele in Chinese population in Shenzhen and analyze the mutation feature for this novel allele.Methods From January to December 2012,a healthy donor with inconclusive MICA genotyping result was selected from patients and donors who registered to do human leukocyte antiges (HLA) genotyping in Shenzhen Blood Center as study object.Self established sequence typing-based method was used to genotype exon 2-5 of MICA gene for this sample.Then the sequence of the MICA allele was identified by cloning and haplotype sequencing.The type of mutation of this MICA allele was characterized by sequence alignment.Results A novel MICA allele was identified in this study.It differed from the closest allele MICA * 010:01 by single nucleotide change at genomic DNA nt637 cytosine (C) to thymine (T) (codon191 CGC to TGC) in exon 4,which resulted in the change of an amino acid (arginine to cysteine).The sequence of this novel allele was submitted to GenBank Database under the accession number JN043370 and the international ImMunoGeneTics project/human leukocyte antigen (IMGT/HLA) Database with number HWS10013775,and the name of MICA * 065 had been officially assigned.Conclusions The mutation of T in novel allele MICA * 065 is a new random mutation,which is not found in any other MICA allele.